"Pocket Monsters: Rekkuu no Houmonsha - Deoxys" ist ein Manga, der sich um die mysteriöse Ankunft des legendären Pokémon Deoxys auf der Erde dreht. Die Handlung beginnt in der Stadt LaRousse, einer futuristischen Metropole, die für ihre fortschrittliche Technologie bekannt ist. Plötzlich erscheint ein seltsames Objekt am Himmel, das sich als Deoxys entpuppt, ein Pokémon aus dem Weltraum. Deoxys' Ankunft löst Chaos aus, da es zunächst als Bedrohung wahrgenommen wird.

Der Protagonist, ein junger Pokémon-Trainer namens Rald, wird in die Ereignisse hineingezogen, als er und sein Pikachu auf Deoxys treffen. Rald versucht, die wahren Absichten von Deoxys zu verstehen, während die Stadt in Panik gerät. Gleichzeitig taucht ein weiteres legendäres Pokémon, Rayquaza, auf, das eine lange Rivalität mit Deoxys zu haben scheint. Die Konfrontation zwischen den beiden Pokémon eskaliert und bedroht die gesamte Stadt.

Während der Handlung wird deutlich, dass Deoxys nicht von Natur aus böse ist, sondern vielmehr verwirrt und verängstigt durch die ungewohnte Umgebung. Rald und seine Freunde versuchen, einen Weg zu finden, den Konflikt zu lösen und Deoxys zu helfen, bevor es zu spät ist. Die Geschichte thematisiert dabei auch die Beziehung zwischen Menschen und Pokémon sowie die Bedeutung von Verständnis und Mitgefühl.

Neben Rald spielen weitere Charaktere eine wichtige Rolle, darunter Professor Lund, ein Wissenschaftler, der die Ereignisse erforscht, und Rebecca, eine junge Frau, die eine enge Verbindung zu Rayquaza hat. Die Handlung ist geprägt von Action, emotionalen Momenten und der Erkundung der Beziehungen zwischen den Charakteren und den Pokémon. Der Manga bietet eine spannende und zugleich nachdenkliche Erzählung, die Fans der Pokémon-Reihe anspricht.