Im Mittelpunkt von „The Unaware Atelier Master“ steht ein junger Alchemist namens Elric, der zurückgezogen in einem abgelegenen Wald lebt und seine Tage der Herstellung von magischen Artefakten und Tränken widmet. Trotz seines außergewöhnlichen Talents ist sich Elric seiner eigenen Fähigkeiten nicht bewusst und hält seine Kreationen für banal und unscheinbar. Seine ruhige Existenz wird gestört, als eine reisende Händlerin, Lila, auf sein Atelier stößt und den immensen Wert seiner Arbeit erkennt. Lila überredet Elric, seine Isolation zu verlassen und sich mit ihr auf eine Reise in die Hauptstadt zu begeben, wo seine Fähigkeiten die Welt verändern könnten.

Im weiteren Verlauf der Geschichte ziehen Elrics Kreationen die Aufmerksamkeit mächtiger Gruppen auf sich, darunter die königliche Alchemistengilde und eine zwielichtige Organisation, die seine Talente zu ihrem eigenen Vorteil ausnutzen will. An der Seite von Lila begegnet Elric den unterschiedlichsten Charakteren, darunter ein erfahrener Schwertkämpfer namens Kael, der zu seinem Beschützer wird, und eine mysteriöse Zauberin namens Seraphina, die Geheimnisse aus Elrics Vergangenheit hütet. In der Geschichte geht es um Selbstfindung, denn Elric lernt allmählich das wahre Ausmaß seiner Fähigkeiten kennen und erfährt, welche Auswirkungen sie auf die Welt um ihn herum haben.