Ein Polizeidetektiv namens Yosuke Kobayashi erleidet einen psychischen Zusammenbruch, nachdem ein Serienmörder seine Frau ermordet hat. Das Trauma spaltet seine Psyche und lässt zwei neue dominante Persönlichkeiten entstehen: Kazuhiko Amamiya, einen ruhigen und brillanten Kriminologen, und Shinji Nishizono, einen rücksichtslosen und gewalttätigen Psychopathen. Nachdem Kobayashi, unter der Kontrolle einer dieser Identitäten, den Mörder seiner Frau gejagt und getötet hat, wird er inhaftiert. Nach seiner Entlassung hat nun die Persönlichkeit namens Kazuhiko Amamiya die Kontrolle. Er wird von Machi Isono aufgenommen, einer scharfsinnigen und einfallsreichen Kriminologin, die eine Privatdetektei leitet. An ihrer Seite wird Amamiya in eine Reihe neuer, noch verstörenderer Serienmorde hineingezogen. Die Opfer und Täter in diesen neuen Fällen teilen ein seltsames, verbindendes Merkmal: einen Strichcode, der in ihr linkes Auge tätowiert ist – ein Merkmal, das auch Amamiya selbst besitzt. Dieser Hinweis lässt ihn glauben, dass seine eigene Identität eine Lüge ist und dass seine alternativen Persönlichkeiten bereits seit seiner Kindheit existierten, lange vor dem Trauma, das sie scheinbar erschuf.

Die Ermittlungen enthüllen eine weitreichende und finstere Verschwörung, die von einer mächtigen und geheimen Organisation namens Gakuso Corporation orchestriert wird. Gakuso verfügt über fortschrittliche Gentechnologie und versucht, den ultimativen Serienmörder neu zu erschaffen – eine legendäre, verstorbene amerikanische Rockstar-Terroristin namens Lucy Monostone. Die Organisation hat das Strichcode-Programm entwickelt, um künstliche Persönlichkeiten in menschlichen Wirten zu implantieren und zu kultivieren. Amamiya und Nishizono entpuppen sich als zwei solcher programmierten Persönlichkeiten, die dazu bestimmt sind, sich schließlich zu vereinen und den Kern einer neuen Lucy Monostone zu bilden. Die Handlung folgt Amamiya und Machi, während sie tiefer in diese Verschwörung eindringen und auf eine Galerie grotesker Mörder treffen, die alle Bauern in Gakusos größerem Spiel sind. Ihre Ermittlungen bringen sie in Konflikt mit anderen Wirten, die Fragmente der Lucy-Persönlichkeit in sich tragen, darunter ein junger Teenager namens Tetora Nishizono, der von einer anderen Version der Shinji-Nishizono-Persönlichkeit dominiert wird. Die Geschichte enthüllt auch, dass Machis eigene jüngere Schwester, Miwa, ein Strichcode-Wirt der neuen Generation ist, der ein entscheidendes Persönlichkeitsfragment für die Wiederauferstehung von Lucy Monostone in sich trägt.

Die Live-Action-Fernsehminiserie, unter der Regie von Takashi Miike, entfaltet sich über sechs Episoden, die jeweils um einen anderen grausamen Fall strukturiert sind, der mit der zentralen Verschwörung verbunden ist. Die erste Episode, Memories of Sin/Drifting Petals, stellt Amamiya und den bizarren Fall eines Mörders vor, der Opfer in menschliche Pflanzgefäße verwandelt. Die Ermittlungen zu einem Serienmörder, der Föten aus schwangeren Frauen entfernt, folgen in How to Create a World. Die dritte Episode, Life Is a Constant Double Helix, zeigt Amamiya undercover an einer militaristischen Highschool, wo er einen Massensuizid von vierzig Mädchen untersucht, die alle Teil einer neuen Generation von Strichcode-Nutzern sind. Die vierte Episode, The Crushed Ant, handelt von einer grausigen Entdeckung zerstückelter Körperteile und einem Bandenkrieg zwischen rivalisierenden Gangs. In Coronation of the Cursed King beginnen Mitglieder des Strichcode-Kults spontan zu verbrennen, was das Team zu einem Krankenhaus mit einer geheimen Etage führt, auf der schreckliche Experimente stattfinden. Die letzte Episode, Soaring Souls and Human Bondage, beschließt die Serie, als die Polizei versucht, die Vorfälle großflächig zu vertuschen, was Amamiya und seine verbliebenen Verbündeten zwingt, die Wahrheit auf eigene Faust zu verfolgen. Die Geschichte gipfelt in einer Konfrontation mit den Kräften hinter der Strichcode-Verschwörung, während Amamiya darum kämpft, seinen vermissten Sohn zurückzugewinnen und seine eigene zersplitterte Identität zu verstehen.