"Punch Line" ist eine Anime-Serie, die eine komplexe Handlung mit Elementen aus Science-Fiction, Comedy und Mystery verbindet. Die Geschichte spielt in einem Wohnheim namens Korai House, in dem der Protagonist Yuta Iridatsu nach einem mysteriösen Vorfall lebt. Nachdem Yuta während eines Busüberfalls Geiselnahme beobachtet, wird er von einem mysteriösen Wesen namens Chiranosuke aus seinem Körper herausgeschleudert und existiert fortan als Geist. Er entdeckt, dass er in diesem Zustand übernatürliche Kräfte besitzt, die jedoch aktiviert werden, wenn er Unterwäsche von Mädchen sieht. Sollte er zweimal in kurzer Zeit erregt werden, löst dies eine Katastrophe aus, die die Erde zerstört.

Yuta lernt die anderen Bewohner des Korai House kennen, darunter die toughe Mikatan Narugino, die als Idol arbeitet, die ruhige und intelligente Meika Daihatsu, die mysteriöse Rabura Chichibu und die Hausverwalterin Ito Hikiotani. Jede von ihnen hat ihre eigenen Geheimnisse und Verbindungen zu den übernatürlichen Ereignissen, die sich um das Wohnheim abspielen. Yuta versucht, seine menschliche Form zurückzugewinnen und gleichzeitig die drohende Apokalypse zu verhindern. Dabei stößt er auf eine Organisation namens QTaro, die hinter den mysteriösen Vorfällen zu stehen scheint.

Im Laufe der Serie werden Zeitreisen, Paralleluniversen und die wahre Natur von Chiranosuke enthüllt. Yuta muss nicht nur die Identität des Busentführers aufdecken, sondern auch die Zusammenhänge zwischen den Bewohnern des Korai House und den übernatürlichen Phänomenen verstehen. Die Handlung ist durch zahlreiche Wendungen und überraschende Enthüllungen geprägt, die die Grenzen zwischen Realität und Fiktion verschwimmen lassen. Am Ende wird deutlich, dass Yutas Schicksal eng mit der Rettung der Welt verknüpft ist und er eine zentrale Rolle in der Abwendung der Katastrophe spielt.