"Nanami-chan" ist eine Anime-Serie, die das Leben eines jungen Mädchens namens Nanami Momozono in den Mittelpunkt stellt. Nanami, eine Schülerin, führt ein relativ normales Leben, bis ihr Vater aufgrund von Spielschulden verschwindet und sie mittellos zurücklässt. Auf der Suche nach einem neuen Zuhause trifft sie auf Tomoe, einen Fuchsgeist (Kitsune), der in einem Schrein lebt. Tomoe ist zunächst widerwillig, bietet Nanami jedoch an, im Schrein zu bleiben, nachdem sie versehentlich einen Vertrag mit ihm geschlossen hat, der ihn an sie bindet.

Im Laufe der Serie entwickelt sich die Beziehung zwischen Nanami und Tomoe von einer rein geschäftlichen Vereinbarung zu einer tieferen emotionalen Verbindung. Nanami übernimmt die Rolle einer Gottheit des Schreins und lernt, mit den Herausforderungen des übernatürlichen Lebens umzugehen. Dabei begegnet sie verschiedenen mythologischen Wesen und Geistern, die sowohl Freunde als auch Feinde darstellen. Die Handlung erkundet Themen wie Verantwortung, Freundschaft und die Balance zwischen der menschlichen und der spirituellen Welt.

Neben Tomoe spielen weitere Charaktere eine wichtige Rolle, darunter Mizuki, eine Schlange, die sich in Nanami verliebt, und Mikage, der frühere Gott des Schreins, der Nanami in ihre neue Rolle einführt. Die Serie kombiniert humorvolle Momente mit ernsteren Themen, während Nanami sich in ihrer neuen Umgebung zurechtfindet und ihre Fähigkeiten als Gottheit entwickelt. Die Handlung ist geprägt von episodischen Abenteuern, die oft moralische Lektionen oder persönliches Wachstum für die Charaktere beinhalten.