Die OVA "Ninja Ryūkenden" basiert auf dem gleichnamigen Videospiel und erzählt die Geschichte des jungen Ninja-Kriegers Ryu Hayabusa, der sich auf eine gefährliche Mission begibt, um die Welt vor einer dunklen Bedrohung zu retten. Ryu, ein Mitglied des Hayabusa-Clans, ist ein Meister der Schwertkunst und verfügt über übernatürliche Fähigkeiten. Sein Vater, ein legendärer Ninja, wurde von einem mysteriösen Feind getötet, und Ryu schwört Rache. Dabei stößt er auf eine uralte Verschwörung, die die Existenz der Menschheit bedroht.

Die Handlung beginnt mit Ryus Suche nach dem Schwert des Dunklen Drachen, einer mächtigen Waffe, die in der Lage ist, die Welt zu zerstören. Auf seiner Reise trifft er auf verschiedene Gegner, darunter rivalisierende Ninja-Clans, dämonische Kreaturen und korrupte Militärführer. Ein zentraler Antagonist ist der skrupellose General Kageri, der das Schwert für seine eigenen machthungrigen Ziele nutzen will. Ryu muss nicht nur gegen äußere Feinde kämpfen, sondern auch mit seinen inneren Dämonen ringen, da er von den Geistern der Vergangenheit und dem Druck, seinem Erbe gerecht zu werden, verfolgt wird.

Im Laufe der Geschichte verbündet sich Ryu mit Irene Lew, einer amerikanischen CIA-Agentin, die ihm bei der Aufklärung der Verschwörung hilft. Irene ist eine starke und eigenständige Figur, die Ryu nicht nur körperlich, sondern auch emotional unterstützt. Ihre Beziehung entwickelt sich im Laufe der Handlung, ohne jedoch die Hauptgeschichte zu dominieren. Gemeinsam enthüllen sie die Existenz eines uralten Drachen, der durch das Schwert des Dunklen Drachen wiedererweckt werden soll. Ryu muss verhindern, dass der Drache die Welt in Chaos stürzt, und gleichzeitig seinen persönlichen Rachefeldzug fortsetzen.

Die OVA kombiniert actionreiche Kampfszenen mit einer düsteren Atmosphäre und einer komplexen Mythologie, die von japanischer Folklore und modernen Elementen inspiriert ist. Ryus Charakter wird als stoisch und entschlossen dargestellt, während die Nebenfiguren, wie Irene und General Kageri, die Handlung durch ihre eigenen Motivationen und Konflikte bereichern. Die Geschichte endet mit einem dramatischen Finale, in dem Ryu seine Fähigkeiten und seinen Willen unter Beweis stellen muss, um die Welt zu retten und seinen persönlichen Frieden zu finden.