"Blue Remains" ist ein Anime-Film, der in einer postapokalyptischen Zukunft spielt, in der die Erde weitgehend von Wasser bedeckt ist. Die Handlung dreht sich um die junge Protagonistin Rina, die in einer isolierten Unterwasserstadt lebt. Diese Stadt, bekannt als "Blue", wurde errichtet, um die letzten Überlebenden der Menschheit vor den verheerenden Auswirkungen einer globalen Katastrophe zu schützen. Rina führt ein scheinbar friedliches Leben, doch sie wird von wiederkehrenden Träumen und Erinnerungen an eine vergangene Welt geplagt, die sie nicht vollständig versteht.

Eines Tages entdeckt Rina ein altes, verlassenes Schiffswrack außerhalb der Stadtgrenzen. Bei der Erkundung trifft sie auf einen mysteriösen Jungen namens Aoi, der behauptet, aus der Oberwelt zu stammen. Aoi erzählt Rina von einer Welt über dem Wasser, die noch existiert, und weckt in ihr den Wunsch, mehr über ihre eigene Vergangenheit und die wahre Natur ihrer Umgebung zu erfahren. Gemeinsam beschließen sie, die Grenzen von "Blue" zu überschreiten und die Oberwelt zu suchen.

Während ihrer Reise stoßen Rina und Aoi auf verschiedene Hindernisse, darunter feindselige Maschinen und die strengen Regeln der Unterwasserstadt, die ihre Bewohner davon abhalten sollen, die Wahrheit zu erfahren. Im Laufe der Geschichte enthüllt sich, dass "Blue" nicht nur ein Schutzort, sondern auch ein Gefängnis ist, das von einer höheren Macht kontrolliert wird, um die Menschheit in Unwissenheit zu halten. Rina muss sich mit ihrer eigenen Identität auseinandersetzen und entscheiden, ob sie weiterhin in der Sicherheit von "Blue" leben oder das Risiko eingehen will, die Wahrheit über die Welt und sich selbst zu entdecken.

Die Charaktere sind geprägt von ihren inneren Konflikten und dem Wunsch nach Freiheit und Wissen. Rina verkörpert die Neugier und den Mut, sich gegen vorgegebene Grenzen aufzulehnen, während Aoi als Symbol für die verlorene Welt und die Hoffnung auf eine bessere Zukunft steht. Der Film thematisiert die Suche nach Identität, die Bedeutung von Freiheit und die Konsequenzen von Wissen in einer kontrollierten Gesellschaft.