Eine hochtrainierte Agentin namens Rei arbeitet für die Zero Section der Metropolitan Police, eine geheime Einheit, die mit der Untersuchung abgeschlossener Fälle betraut ist, die offizielle Kanäle nicht anfassen können. Unter Gedächtnisverlust leidend, den sie während ihrer Ausbildung erlitt, sieht sich Rei auf zwei parallelen Wegen: einer ist eine externe Ermittlung gegen einen Menschenhandelsring, der junge Frauen ausbeutet, der andere eine innere Suche nach den Fragmenten ihrer eigenen vergessenen Vergangenheit.

Der Fall eskaliert dramatisch, als eine aufstrebende Terroristengruppe ein klassifiziertes und tödliches Killervirus in ihre Gewalt bringt und damit droht, es über die Bevölkerung auszubreiten. Als Reaktion darauf weist die Öffentliche Sicherheit eine junge Spezialistin zur Unterstützung der Ermittlungen zu. Sarah Kodama, eine Expertin für Molekularbiologie und Informatik, wird als Partnerin zu Rei geschickt. Doch die einsame und zutiefst misstrauische Rei weigert sich, mit ihr zusammenzuarbeiten. Unbeeindruckt von Reis Kälte entwickelt Sarah eine intensive Neugier auf die mysteriöse Agentin. Sie beginnt, in Reis Vergangenheit zu graben und sucht schließlich Asami auf, Reis ehemalige Vorgesetzte.

Während Sarah tiefer in die Geheimnisse der Zero Section eindringt, deckt sie eine Verschwörung auf, die weit größer ist als ein einfacher Terroranschlag. Der Mann, der vor ihr erscheint, ist kein Verbündeter, sondern ein Auftragskiller mit dem Auftrag, die Zero Section vollständig zu zerstören. Die Ermittlungen zwingen Rei, sich den Lücken in ihrem Gedächtnis zu stellen, die eng mit genau den Verbrechern, die sie jagt, und der schattenhaften Organisation, für die sie arbeitet, verknüpft sind. Als die Terroristen ihre Frist für den Angriff bekannt geben, muss Rei die neugierige Sarah schützen, die Freisetzung des Virus verhindern und endlich die Wahrheit enthüllen, die in ihren eigenen verlorenen Erinnerungen verborgen liegt.