"SOS" ist eine Manga-Serie, die in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Menschheit von einer mysteriösen Bedrohung heimgesucht wird. Die Handlung dreht sich um eine Gruppe von Jugendlichen, die in einer abgelegenen Einrichtung leben, die als letzte Zuflucht vor der zerstörerischen Kraft, die als "Schwarzer Wind" bekannt ist, dient. Dieser Schwarze Wind vernichtet alles Leben, das ihm begegnet, und hat bereits weite Teile der Welt verwüstet. Die Einrichtung, in der die Protagonisten leben, ist streng abgeschottet und wird von einer undurchsichtigen Organisation kontrolliert, die behauptet, die Jugendlichen zu schützen.

Die Hauptfiguren sind eine Gruppe von Jugendlichen, die in der Einrichtung aufwachsen und sich mit den strengen Regeln und der Isolation arrangieren müssen. Unter ihnen ist der Protagonist, ein junger Mann namens Kakeru, der von Natur aus neugierig und rebellisch ist. Kakeru beginnt, die wahren Absichten der Organisation in Frage zu stellen, als er auf mysteriöse Weise mit dem Schwarzen Wind in Kontakt kommt, ohne dabei Schaden zu nehmen. Dieses Ereignis weckt sein Misstrauen und führt dazu, dass er zusammen mit seinen Freunden, darunter die intelligente und pragmatische Aoi und der zurückhaltende, aber loyaler Riku, beginnt, die Geheimnisse der Einrichtung zu erforschen.

Im Laufe der Geschichte enthüllt sich, dass die Organisation die Jugendlichen für Experimente missbraucht, um eine Möglichkeit zu finden, den Schwarzen Wind zu kontrollieren oder zu nutzen. Die Protagonisten entdecken, dass sie selbst Teil dieser Experimente sind und dass ihre Fähigkeiten, dem Schwarzen Wind zu widerstehen, auf genetischen Manipulationen beruhen. Diese Erkenntnis treibt sie dazu, gegen die Organisation zu rebellieren und nach einem Weg zu suchen, die wahre Natur des Schwarzen Windes zu verstehen und möglicherweise die Welt zu retten.

Die Handlung ist geprägt von Spannung, moralischen Dilemmata und der Frage, wie weit man gehen darf, um das Überleben der Menschheit zu sichern. Die Charaktere entwickeln sich im Laufe der Geschichte weiter, wobei ihre Beziehungen zueinander und ihre individuellen Motivationen im Mittelpunkt stehen. Die Serie kombiniert Elemente von Science-Fiction, Mystery und Drama, um eine komplexe und fesselnde Erzählung zu schaffen, die die Leser bis zum Ende in Atem hält.