Sieben Jahre vor Beginn der Geschichte führte die Menschheit einen geheimen Krieg um ihr Überleben gegen göttliche Wesen. Um den Konflikt zu beenden, wurden ein Mädchen namens Waka und ihre Gefährten von den Göttern auserwählt, zu Walküren zu werden, und gaben ihr Leben, um die göttliche Bedrohung zu stoppen. Nun ist Wakas jüngere Schwester Kiko erwachsen geworden und beginnt die Oberschule, wo sie versucht, ein normales Leben zu führen. Doch die göttlichen Wesen sind zurückgekehrt und zwingen Kiko, sich mit dem Vermächtnis der Opfergabe ihrer Schwester und der erneuten Gefahr für die Menschheit auseinanderzusetzen. Die Erzählung folgt Kiko, während sie sich in der Oberschule zurechtfindet und zugleich in das Wiederaufleben dieses verborgenen Krieges verwickelt wird, wobei die Walküren, die einst das Leben ihrer Schwester forderten, nun Interesse an ihr zeigen. Die Geschichte spielt in einer zeitgenössischen Welt, in der sich unter der Oberfläche des Alltagslebens ein verdeckter Kampf gegen übernatürliche göttliche Entitäten abspielt. Zentrale Handlungsbögen umfassen die anfängliche Enthüllung der Rückkehr der göttlichen Wesen, Kikos Entdeckung ihrer Verbindung zu den Walküren und ihren Kampf, die Welt zu beschützen, für die ihre Schwester starb.