Auf dem Heimweg von der Schule will der Oberschüler Jin Okuhara seiner Kindheitsfreundin Komachi Amamiya seine Liebe gestehen, als die beiden abrupt in eine andere Welt versetzt werden. Sie fallen in ein dunkles, tiefes Loch, bekannt als der Billbaim-Abgrund, ein verbotenes Land, das als erfüllt von Wahnsinn und Unzucht beschrieben wird. In dieser feindlichen Umgebung werden sie sofort von einer riesigen Tentakelkreatur angegriffen. Um Komachi zu beschützen, wird Jin von dem Monster verschlungen und verliert scheinbar sein Leben.

Jin stirbt jedoch nicht. Er erwacht und entdeckt, dass er als kleines, schwaches Tentakelmonster wiedergeboren wurde – ein Fragment, das von genau der Kreatur ausgespuckt wurde, die ihn verschlungen hat. Jin kämpft mit seiner neuen monströsen Form und erkennt, dass sein Tentakelkörper mit mächtigen Instinkten ausgestattet ist, darunter ein aggressiver Drang, Frauen anzugreifen. Er fürchtet, dass sein Bewusstsein aufhören wird, menschlich zu sein, wenn diese Triebe stärker werden. Nach dieser traumatischen Verwandlung wird Jin von einer Gruppe von Entdeckern gerettet, die auch Komachi aufgenommen haben. Gemeinsam bilden sie ein Erkundungsgeschwader, das sich der Erforschung der Geheimnisse des Abgrunds widmet, den sie das Tentakelloch nennen.

Die Serie folgt Jin, während er mit seiner doppelten Existenz ringt. Anfangs ist seine Tentakelform klein und misst nur etwa 63,5 cm, aber er besitzt die einzigartige Fähigkeit, sich in eine humanoide Gestalt zu verwandeln, indem er die volle Kraft seines Ursprungs annimmt: die Vismaria-Klasse. Als Fragment dieser stärksten Art von Tentakelmonstern ist Jin immer noch mit einem Schwarmbewusstsein verbunden, das ihn mit aggressiven und sexuellen Begierden bombardiert. Er lernt, seine Fähigkeiten im Kampf einzusetzen, indem er seine Anhängsel manipuliert, um Waffen oder riesige Hände zu formen, wobei er rohe Stärke, schnelle Regeneration und die Produktion eines heilenden Schleims nutzt. Das Geschwader entdeckt bald, dass Tentakelkreaturen eine spezifische Schwäche haben: einen Kristallkern, der, wenn er zerstört wird, ihre Regeneration verhindert. Sie lassen sich auch leicht vom Geruch von Frauen ablenken, ein Fehler, den Erkundungsteams ausnutzen, um ihre Kerne für Angriffe freizulegen.

Die Erzählung führt eine Vielzahl von Charakteren ein, die diese dunkle Welt bewohnen. Komachi bleibt Jins wichtigster emotionaler Anker und seine Liebesinteresse, sein Wille, sie zu beschützen, dient als Schlüssel, um die Kontrolle über seine monströse Seite zurückzugewinnen. Das Erkundungsgeschwader besteht aus abgehärteten Mitgliedern wie Kapitän Dazune, Kapitän Aishu und Kämpfern wie Hiori und Lingue, von denen einige traumatische Erfahrungen mit den Tentakeln haben. Nicht alle Menschen sind Verbündete; einige Gruppen benutzen Mädchen wie Lylara als Tentakelköder und missbrauchen sie für finanziellen Gewinn. Im Verlauf der Geschichte sieht sich das Geschwader einer neuen, intelligenten Bedrohung gegenüber, bekannt als Liao, einer mächtigen Tentakelentität, die Komachi unerbittlich verfolgt. Die Menschen und Jin sind gezwungen, sich diesen weiterentwickelten, halbmenschlichen Tentakeln zu stellen, die noch größere List und Bosheit besitzen als die gewöhnlichen Bestien. Nach einer knappen Flucht wird Komachi von Dazune zu einer Einrichtung geführt, die eine letzte Trumpfkarte beherbergt, ein letztes Mittel, um den monströsen Verfolger ein für alle Mal zu besiegen.