In der modernen Stadt Nagano, insbesondere rund um den Tempelbezirk von Zenkoji, erscheint ohne Vorwarnung ein mysteriöses und mächtiges Wesen. Es ähnelt einer alten Tonidol, bekannt als Dogū, und beginnt einen unerbittlichen Zerstörungszug, bei dem es jeden tötet, der ihm über den Weg läuft. Die örtliche Polizei und das Militär sind völlig machtlos gegen diese Kreatur aus einer vergangenen Ära.

Der Öffentlichkeit unbekannt, hatten jedoch bestimmte Personen diesen Tag vorhergesehen und sich im Geheimen darauf vorbereitet. Diese Gruppe gehört zu einer obskuren Abteilung für Shinto-Studien an einer örtlichen Universität. Sie sind die einzige Hoffnung gegen diese Bedrohung. Ihre Methode zur Bekämpfung der Kreatur ist ein spezielles Shinto-Ritual mit zeremoniellen Tänzen, das es einer menschlichen Seele ermöglicht, eine Tonrüstung zu bewohnen und zu beleben, wodurch ein uralter Krieger namens Haniwatt entsteht. Der Protagonist, ein junger Mann namens Jin, wird der erste dieser Krieger, der sich stellt, sich verwandelt und dem Ansturm des Monsters entgegentritt.

Die Geschichte ist ein Action-Seinen, geschrieben und illustriert von Kenji Taketomi. Die Erzählung schöpft stark aus der japanischen Geschichte und Folklore, wobei ihre Monster auf echten Dogū- und Haniwa-Statuetten aus der prähistorischen Jōmon-Zeit basieren. Der Autor entwickelte die ursprüngliche Idee für die Geschichte während seiner Grundschulzeit und verfeinerte sie später zu einer Hommage an die Tokusatsu- und Mecha-Anime-Klassiker der 1970er und 1980er Jahre. Der Weltenbau ist bewusst gründlich und integriert Elemente der Shinto-Philosophie, um die Regeln und Mechanismen der Funktionsweise der Haniwatt zu erklären, was es von rein science-fictionartigen Erzählungen unterscheidet.

Jin, der erste Haniwatt-Krieger, der mit Kagutsuchi verbunden ist, erleidet eine vollständige Niederlage durch den primären Dogū, der als Dogūn bezeichnet wird. Infolgedessen wird eine Priesterin namens Yuri, die aufgrund schwerer Verletzungen im Krankenhaus lag, zurückgerufen. Gleichzeitig beschwört ein anderer Krieger namens Yayoi Oguna Rin Funato, einen Haniwatt von Magatsutsuchi, nach Nagano. Zusammen mit Priestern des Togakushi-Schreins beginnen sie mit den Vorbereitungen für eine zweite entscheidende Schlacht gegen den Dogūn.

Im Verlauf der serialisierten Geschichte beginnt der dritte Teil mit dem Titel Wandernde Erinnerungen einen neuen Handlungsbogen namens Das Kapitel von Kofu Fujikawa. Dieser Bogen verlagert den Fokus auf eine andere Figur, Makio, der sich darauf vorbereitet, als Haniwatt aufzubrechen. Er wird von schmerzhaften Erinnerungen an eine Rivalität mit seinem Halbbruder um die Macht gequält, selbst als seine Mutter ihm aufmunternde Worte mit auf den Weg gibt.