Als Ai Saotome noch ein kleines Kind war, rettete ihr ein Junge bei einem Unfall das Leben. Sie blieb unverletzt, doch der junge Held trug eine bleibende, halbmondförmige Narbe zwischen den Augen davon. Jahre später erfährt Ai, mittlerweile eine talentierte und wohlhabende Oberschülerin, die als Engel der Aobadai-Akademie bekannt ist, die Identität ihres geheimnisvollen Retters. Es ist Makoto Taiga, ein gewalttätiger und verbitterter Delinquent, der alle Härten seines harten Lebens, einschließlich der Scheidung seiner Eltern, auf die Narbe zurückführt, die er an jenem Tag erhielt.

Getrieben von einem starken Schuldgefühl und der Überzeugung, dass unter seiner brutalen Fassade ein guter Mensch steckt, überredet Ai ihren Vater, Makotos Vormund zu werden und ihn an ihre angesehene Schule zu versetzen, um ihn zu rehabilitieren. Makoto jedoch ist nicht dankbar. Er ist wütend und entschlossen, Ai den Schmerz spüren zu lassen, den er erlitten hat. Er sorgt absichtlich für Chaos an der Aobadai und beschmutzt Ais perfekten Ruf, doch sie gibt ihn nicht auf. Als seine gewalttätigen Pläne vereitelt werden, wechselt Makoto an die Hanazono Jitsugyo, die weithin als die delinquenteste Oberschule der Kantō-Region gilt, ein Ort, der von mächtigen Schülern mit Verbindungen zur Unterwelt beherrscht wird. Entschlossen, ihm zu folgen und ihre Mission fortzusetzen, wechselt Ai an dieselbe gefährliche Schule, begleitet von dem schüchternen und ergebenen Klassensprecher Hiroshi Iwashimizu, der sie heimlich liebt.

In Hanazono, bekannt als der „Garten des Bösen“, werden Ai und Makoto in eine Welt gewalttätiger Revierkämpfe gestürzt. Sie stellen sich Yuki Takahara, einer Meisterin des Messerwerfens und eleganten, aber rücksichtslosen Anführerin der Mädchengang der Schule, sowie dem geistig behinderten, aber erschreckend starken Gonda Zaō, der als Schatten-Schulleiter fungiert und Yuki erbittert beschützt. Neben diesen rivalisierenden Schülern treffen sie auch auf Shun Sadoya, ein „teuflisches Genie“ mit einer Peitsche, das eine junge Mafia-Gruppe anführt, die die Schule übernehmen will. Makoto kämpft sich durch diese gewalttätigen Konflikte, wobei jeder Kampf mehr von seiner eigenen schwierigen Vergangenheit offenbart, einschließlich der Geschichte seiner Mutter, die ihn verließ.

Die Erzählung eskaliert von Schulhofschlägereien zu einer politischen Verschwörung mit hohen Einsätzen, als Ais Vater in einen Korruptionsskandal verwickelt und verhaftet wird. Makoto, der den Fall allein übernimmt, kämpft sich durch die Drahtzieher des Komplotts, was zur Verhaftung eines korrupten Premierministers führt. Gerade als diese lange und schwierige Reise ein friedliches Ende zu nehmen scheint und Makoto und Ai einen Moment des Glücks vergönnt ist, taucht der rachsüchtige Shun Sadoya wieder auf und ersticht Makoto. Im tragischen Finale schleppt Makoto seinen verletzten Körper zum Strand, wo die wartende Ai ihn ein letztes Mal sieht, bevor ihr kurzes Glück ein Ende findet.