Arakura Arato ist ein Oberschüler, dessen Lebensphilosophie die Vermeidung von Krisen ist. Seine ständige Wachsamkeit hat sich als unsichtbare Barriere manifestiert, eine EMO-Fähigkeit – übernatürliche Kräfte, die aus starken Emotionen entstehen. Sein ruhiges, unauffälliges Dasein zerbricht, als er plötzlich von Konomi Kirara angegriffen wird, einer Frau mit der Fähigkeit, Materie verrotten zu lassen. Konomi enthüllt, dass sie eine Offizierin der CES, der Anti-EMO-Einheit, ist und dass Arato ein EMO-Nutzer ist. Sie erklärt, dass EMO-Fähigkeiten in den Kernemotionen des Nutzers verwurzelt sind, wie sie im Rad der Emotionen des Psychologen Robert Plutchik dargestellt werden.

Gezwungen, sich nur mit einer defensiven Barriere zu verteidigen, gelingt es Arato, Konomi bei ihrer ersten Begegnung auszutricksen, doch das zieht ihn in einen verborgenen Konflikt zwischen EMO-Nutzern hinein. Er erfährt, dass seine geliebte jüngere Schwester Aira ebenfalls eine EMO-Nutzerin ist und von einer kriminellen Organisation namens die Maskierten entführt wurde. Um sie zu finden, erklärt sich Arato bereit, mit der CES zusammenzuarbeiten. Er wird einem Team exzentrischer Kollegen zugeteilt, darunter die gerechtigkeitsgetriebene Konomi, und beginnt, die Aktivitäten der Maskierten zu untersuchen.

Die Erzählung folgt Arato, während er gegen eine Vielzahl von EMO-Nutzern kämpft – Feinde, die die Zeit zurückdrehen, Gegenstände zertrümmern, Wahrscheinlichkeiten manipulieren und mehr. Jede Kraft entspricht einer bestimmten Emotion und verwandelt Kämpfe in taktische Rätsel, bei denen Arato seine vielseitige, aber rein defensive Barriere einsetzen muss. Als er seinen CES-Teamkollegen näher kommt, kämpft er mit der Enthüllung, dass Aira ein freiwilliges Mitglied der Maskierten geworden ist, nachdem ihr Gedächtnis bei einem Zusammenstoß gelöscht wurde. Aratos eigene Fähigkeit verschwindet plötzlich während einer Reihe eskalierender Vorfälle, was ihn verwundbar macht. Die Maskierten starten einen direkten Angriff auf das CES-Hauptquartier, wo ein Nutzer des „Schicksals“ das Team mit Wahrscheinlichkeitsmanipulation überwältigt. Völlig besiegt und von seiner gedächtnisgelöschten Schwester zurückgewiesen, verfällt Arato in Verzweiflung. Doch gestärkt durch seine Kameraden, fasst er den Entschluss, sich wieder zu erheben und startet einen Gegenangriff, um Aira zurückzuholen und die Pläne der Maskierten zu stoppen. Die Geschichte ist ein psychologischer Kampf-Manga, in dem Emotionen Waffen sind und die Grenze zwischen Beschützer und Bedrohung ständig verschwimmt.