Im Zentrum von Kagura ga Yuku! steht die stellvertretende Schulsprecherin Kagura, deren ganze Welt sich um den Schulsprecher Kanamori dreht, dem sie sich seit über zehn Jahren verschrieben hat. Ihre unerschütterliche Hingabe bestimmt jede ihrer Handlungen, wobei Kanamoris Glück und Wohlbefinden ihre einzige Priorität sind. Dieses Gleichgewicht gerät ins Wanken, als eine neue Schülerin, Misono, an die Schule kommt. Kanamori ist sofort hingerissen und erlebt zum ersten Mal die Liebe. Allerdings ist er zu schüchtern und zögerlich, um seinen Gefühlen nachzugehen oder Misono auch nur anzusprechen.

Als Reaktion darauf nimmt Kagura es auf sich, die Architektin von Kanamoris Romanze zu werden. In dem Glauben, dass nichts unmöglich ist, wenn es darum geht, ihrem geliebten Präsidenten zu dienen, stürzt sie sich in die Mission, Misono Kanamoris Charme und Tugenden zu vermitteln, während sie gleichzeitig die absurden Situationen meistert, die aus ihren übereifrigen und wortwörtlichen Methoden entstehen.

Die Handlung spielt in einer lebhaften Schulumgebung, wo die komödiantische Spannung aus dem Kontrast zwischen Kaguras hyperkompetenter, entschlossener Art in allen Angelegenheiten, die Kanamori betreffen, und ihrer Ahnungslosigkeit gegenüber ihren eigenen Gefühlen entsteht. Die Erzählung schreitet durch eine Reihe eskalierender komödiantischer Pläne voran, die von Kagura orchestriert werden, darunter ein Hausdate in Kanamoris Villa und eine chaotische Outdoor-Schulreise. Der zentrale Konflikt vertieft sich mit der Ankunft einer neuen Figur, eines Mädchens namens Takao, das als Kanamoris Verlobte vorgestellt wird, was eine potenzielle Liebesrivalin schafft und Kagura zwingt, sich neuen Komplikationen zu stellen. Die Geschichte baut darauf auf, dass Kanamori Misono endlich seine Liebe gesteht, was die Grenzen von Kaguras Loyalität und die Beziehungen des Trios in einer hektischen Schülerratskomödie auf die Probe stellt.