"Darker than Black: Shikkoku no Hana" ist ein Manga, der im selben Universum wie die Anime-Serie "Darker than Black" spielt, jedoch eine eigenständige Handlung verfolgt. Die Geschichte beginnt in einer Welt, in der mysteriöse Phänomene, bekannt als "Himmelstor" und "Höllentor", die Realität verändert haben. Durch diese Ereignisse sind sogenannte "Vertragspartner" entstanden, Menschen mit übernatürlichen Fähigkeiten, die jedoch für die Nutzung ihrer Kräfte einen Preis zahlen müssen, oft in Form von zwanghaften oder seltsamen Verhaltensweisen.

Die Protagonistin, Suou Pavlichenko, ist ein junges Mädchen, das in einer von Konflikten geprägten Welt aufwächst. Nach dem Tod ihres Vaters, eines ehemaligen Vertragspartners, wird sie von einer Organisation namens "Syndikat" rekrutiert, die Vertragspartner für ihre eigenen Zwecke einsetzt. Suou besitzt die Fähigkeit, Objekte in Waffen zu verwandeln, und muss lernen, mit den Konsequenzen ihrer Macht umzugehen. Ihr Begleiter ist Hei, auch bekannt als "BK-201", ein geheimnisvoller und erfahrener Vertragspartner, der eine zentrale Rolle in der Anime-Serie spielt. Hei fungiert als Mentor für Suou und hilft ihr, sich in der gefährlichen Welt der Vertragspartner zurechtzufinden.

Die Handlung konzentriert sich auf Suous Entwicklung und ihre Beziehung zu Hei, während sie gemeinsam gegen verschiedene Bedrohungen kämpfen. Dabei werden Themen wie Verlust, Identität und die moralischen Dilemmata der Nutzung übernatürlicher Kräfte untersucht. Die Geschichte ist geprägt von politischen Intrigen, Kämpfen zwischen rivalisierenden Organisationen und den persönlichen Konflikten der Charaktere. Suou muss sich nicht nur mit äußeren Feinden auseinandersetzen, sondern auch mit ihren inneren Ängsten und der Frage, was es bedeutet, ein Vertragspartner zu sein.

Der Manga bietet eine düstere und komplexe Erzählung, die die Welt von "Darker than Black" weiter ausbaut und neue Perspektiven auf bekannte Charaktere und Konzepte bietet. Die Handlung ist eng mit den Ereignissen der Anime-Serie verknüpft, bleibt aber eigenständig genug, um auch für neue Leser zugänglich zu sein.