Die Manga-Serie "Persona 4" basiert auf dem gleichnamigen Rollenspiel und erzählt die Geschichte einer Gruppe von Jugendlichen, die in die mysteriösen Ereignisse der Kleinstadt Inaba verwickelt werden. Der Protagonist, ein namenloser Schüler, zieht für ein Jahr zu seinem Onkel Dojima und seiner Cousine Nanako in die ländliche Stadt. Kurz nach seiner Ankunft beginnt eine Reihe unerklärlicher Morde, die mit einem seltsamen Fernsehprogramm namens "Midnight Channel" in Verbindung stehen. Dieses Programm zeigt angeblich die zukünftigen Opfer, bevor sie sterben.

Der Protagonist und seine neuen Freunde entdecken, dass sie in eine andere Welt, das sogenannte "Fernsehreich", eintreten können. Dort begegnen sie ihren eigenen inneren Ängsten und Unsicherheiten, die in Form von Schatten manifestiert werden. Durch die Konfrontation mit diesen Schatten erlangen sie die Fähigkeit, sogenannte "Personas" zu beschwören – mächtige Wesen, die ihre Persönlichkeit verkörpern und im Kampf gegen die Bedrohungen des Fernsehreichs eingesetzt werden können. Die Gruppe beschließt, die Morde aufzuklären und die Identität des mysteriösen Mörders zu enthüllen, der die Opfer ins Fernsehreich lockt.

Zu den Hauptcharakteren gehören neben dem Protagonisten seine Klassenkameraden Yosuke Hanamura, ein energiegeladener Junge, der nach einem Sinn in seinem Leben sucht, und Chie Satonaka, eine sportliche und entschlossene Schülerin. Auch die ruhige und intelligente Yukiko Amagi, die scheue und künstlerisch begabte Rise Kujikawa sowie der junge Detektiv Naoto Shirogane schließen sich der Gruppe an. Jeder Charakter hat eine persönliche Geschichte und innere Konflikte, die im Laufe der Handlung thematisiert werden.

Die Handlung entwickelt sich zu einem komplexen Rätsel, bei dem die Gruppe nicht nur gegen die Schatten kämpft, sondern auch die Wahrheit über die Verbindung zwischen dem Fernsehreich, den Morden und ihren eigenen Identitäten aufdeckt. Dabei werden Themen wie Selbstakzeptanz, Freundschaft und die Konfrontation mit der eigenen Dunkelheit zentral. Die Geschichte erreicht ihren Höhepunkt, als die Gruppe den wahren Schuldigen hinter den Morden entlarvt und sich einer finalen Bedrohung stellen muss, die das Schicksal der gesamten Stadt bedroht.