Shinnosuke Nohara steht im Mittelpunkt von "Eiga Crayon Shin-chan Shūrai! Uchūjin Shiriri." Nachdem ein Außerirdischer namens Shiriri seine Eltern Hiroshi und Misae mit einem mysteriösen Strahl in Kinder verwandelt hat, muss Shinnosuke einen Weg finden, sie wiederherzustellen. Die Lösung erfordert, Shiriris Vater irgendwo in Japan zu finden. Shinnosuke reist mit Shiriri, der in seinem Gesäß versteckt ist, durch das Land und passt sich den seltsamen Umständen an. Was als familiäres Problem beginnt, breitet sich bald auf Shinnosukes Freunde aus und erfasst schließlich die ganze Nation. Die Erzählung folgt Shinnosukes Suche, die Verwandlung seiner Eltern rückgängig zu machen und die eskalierende Krise zu bewältigen, die durch die außerirdische Verschwörung von Shiriris Vater verursacht wird.