In den Wirren nach der Shimabara-Rebellion von 1637–1638 hat das Tokugawa-Shogunat einen christlichen Aufstand niedergeschlagen und dessen jungen Anführer, Amakusa Shirō Tokisada, hingerichtet. Doch die Geschichte endet nicht mit seinem Tod. Ein alter Zauberer und Ninjutsu-Meister, Mori Sōiken, der die Rebellion überlebte, besitzt eine verbotene Technik namens Makai Tenshō – Dämonenreich-Reinkarnation. Diese Kunst nutzt den Körper einer Frau als Kokon; ein sterbender Krieger von unermesslichem Willen kann als dämonisches Wesen mit gesteigerter Stärke und Grausamkeit wiedergeboren werden, gebunden an Sōikens Ehrgeiz, das Shogunat zu stürzen.

Die Geschichte beginnt, als der Stratege Yui Shōsetsu und der legendäre Schwertkämpfer Miyamoto Musashi zufällig Zeuge werden, wie Sōiken das Ritual zur Wiederbelebung von Amakusa Shirō und des Mörders Araki Mataemon durchführt. Shōsetsu, der das Ziel teilt, das Shogunat zu zerstören, wird Sōikens Schüler. In den folgenden Jahren sammeln Sōiken, Shōsetsu und der wiederbelebte Amakusa eine Armee untoter Krieger – historische Persönlichkeiten, die mit tiefem Bedauern starben. Darunter sind der rachsüchtige Schwertkämpfer Tamiya Bōtarō, der Speermeister Hōzōin Inshun, der listige Yagyū Munenori (Vater des Haupthelden) und schließlich sogar Miyamoto Musashi selbst, der von seiner Angst verführt wird, in Vergessenheit zu geraten.

Als diese Armee – bekannt als die Makai Shū (Dämonenreich-Schar) – wächst und sich mit dem ehrgeizigen Daimyō Tokugawa Yorinobu vom Kishū-Zweig verbündet, bereiten sie sich darauf vor, Japan ins Chaos zu stürzen. Doch der mächtigste potenzielle Rekrut ist der einhändige, einäugige Schwertkämpfer Yagyū Jūbei Mitsuyoshi, ein freiheitsliebender Meister der Yagyū Shinkage-ryū. Sōiken sieht Jūbei als Krone seiner Dämonenarmee und versucht, ihn durch die Kunoichi und Agentin Clara Oshina zu korrumpieren. Doch Jūbei, der die Wahrheit entdeckt, bricht den Bann und beschließt, sich der Invasion zu widersetzen.

Die Erzählung folgt Jūbei, wie er eine bunt gemischte Gruppe von Verbündeten sammelt – darunter die drei mutigen Töchter der Kishū-Samurai, O-nui, O-hiro und O-hina, und seine treuen, aber entbehrlichen Gefolgsleute, die sogenannten Yagyū-Zehn – und durch die Landschaften der Provinz Kii auf einer Pilgerreise zieht, die zu einer Reihe von Duellen wird. Jeder Kampf ist eine Konfrontation auf Leben und Tod gegen eine wiedergeborene Legende: zuerst Tamiya Bōtarō am Seiganto-ji-Tempel, dann Hōzōin Inshun auf den Klippen von Sandanpeki und später Yagyū Nyūnsai (Jūbeis eigener Onkel) am Dōjō-ji. Jūbei wird an seine Grenzen gebracht, verliert Kameraden, erringt aber auch kleine Siege, während er langsam die Verschwörung hinter dem Wiederbelebungsritual aufdeckt.

Wichtige Nebenhandlungen betreffen die tragische Kunoichi Clara Oshina, die Sōiken aus Liebe zu Jūbei verrät und sich opfert, um die Talismanfinger zu zerstören, die Sōiken für die Reinkarnationsmagie verwendet. Der letzte Handlungsbogen sieht Jūbei, wie er sich seinem eigenen wiederbelebten Vater, Yagyū Munenori, in einer angespannten Konfrontation am Familiengrab stellt und dann dem wiederbelebten Miyamoto Musashi in einem entscheidenden Duell auf einer kleinen Insel gegenübertritt, die an Ganryūjima erinnert. Nachdem er jeden Dämon besiegt hat, muss Jūbei auch verhindern, dass Tokugawa Yorinobu die Hölle auf Erden entfesselt.

Durchgehend betont der Manga den Schrecken der Verwandlung: Die einst ehrenhaften Samurai werden zu brutalen Monstern, und die Grenze zwischen Mensch und Dämon verschwimmt. Die Geschichte verbindet historische Figuren mit übernatürlicher Action, übernatürlichem Horror und dem einsamen Heldentum eines Mannes, der sich weigert, sich entweder dem Shogunat oder den Verlockungen dämonischer Macht zu beugen. Sie endet damit, dass Jūbei, erschöpft aber siegreich, den Gefallenen seinen Respekt zollt, während die zerschmetterten Überreste der Verschwörung verblassen – obwohl die Narben auf dem Land und in seiner Seele bleiben.