"Zō no Inai Dōbutsuen" ist ein Anime-Film, der in einer Welt spielt, in der Tiere nach und nach verschwinden. Die Handlung konzentriert sich auf einen Zoo, in dem die Tiere durch lebensgroße Roboter ersetzt werden, um die Besucher nicht zu enttäuschen. Der Protagonist, ein junger Mann namens Shun, arbeitet in diesem Zoo und kümmert sich um die Roboter-Tiere. Eines Tages wird er von seiner Chefin, der Zooleiterin, beauftragt, den Roboter-Elefanten zu reparieren, der plötzlich ausgefallen ist. Während er sich mit dieser Aufgabe beschäftigt, trifft er auf eine mysteriöse Frau namens Aki, die behauptet, die letzte echte Tierpflegerin zu sein.

Aki erzählt Shun von einer Zeit, in der echte Tiere noch existierten, und weckt in ihm Zweifel an der Richtigkeit der Roboter-Tiere. Gemeinsam beginnen sie, die Wahrheit hinter dem Verschwinden der Tiere zu erforschen. Dabei stoßen sie auf eine Organisation, die behauptet, die letzten echten Tiere zu schützen, aber in Wirklichkeit dunkle Geheimnisse verbirgt. Shun und Aki müssen sich entscheiden, ob sie weiterhin an der Illusion der Roboter-Tiere festhalten oder den Mut aufbringen, die Realität zu akzeptieren.

Die Geschichte thematisiert die Beziehung zwischen Mensch und Natur sowie die ethischen Fragen, die sich aus dem Einsatz von Technologie ergeben. Die Charaktere sind vielschichtig, insbesondere Shun, der zwischen seiner Pflicht gegenüber dem Zoo und seiner wachsenden Skepsis gegenüber der künstlichen Welt hin- und hergerissen ist. Aki dient als Katalysator für seine Entwicklung und repräsentiert die Verbindung zur Vergangenheit und zur natürlichen Welt. Der Film kombiniert ruhige, nachdenkliche Momente mit spannenden Enthüllungen, die die Zuschauer in eine Welt voller Geheimnisse und moralischer Dilemmata eintauchen lassen.