Scooby-Doo und Shaggy Rogers reisen auf ein ultimatives kulinarisches Abenteuer nach Japan, aber ihr begeistertes Essen setzt versehentlich Hunderte von schelmischen Fabelwesen frei, die sich über das ganze Land verteilen. Um das Chaos einzudämmen, muss das Duo jedes Wesen einfangen, bevor der übernatürliche Ausbruch außer Kontrolle gerät. Sie werden begleitet von Daisuke-Doo, Scoobys Onkel, der die lokale Folklore kennt; Yume, einem magischen Mädchen mit geheimnisvollen Kräften; und Takumi, einem Technologieexperten, der für die Jagd Geräte baut. Gemeinsam jagt dieses ungewöhnliche Team Yokai und andere Kreaturen, die von der japanischen Mythologie inspiriert sind, und verbindet klassische Scooby-Doo-Slapstick-Einlagen mit einem frischen kulturellen Setting. Die Geschichte entfaltet sich als eine Reihe von Monsterjagden, bei denen jede eine neue Bedrohung offenbart und die Bindungen zwischen den Charakteren vertieft, während Shaggy und Scooby lernen, sich mit neuen Verbündeten in einer unbekannten Welt zurechtzufinden.