"Made in Abyss" ist ein Anime-Film, der die Handlung der gleichnamigen Serie fortsetzt und die Geschichte von Riko, Reg und Nanachi vertieft. Der Film spielt in einer Welt, die von einem riesigen, mysteriösen Abgrund dominiert wird, der als "Abyss" bekannt ist. Dieser Abgrund ist voller gefährlicher Kreaturen, unerforschter Schätze und Geheimnisse, die die Menschheit seit Jahrhunderten faszinieren. Riko, ein junges Mädchen, das in der Stadt Orth aufwächst, träumt davon, wie ihre Mutter, eine berühmte Höhlenforscherin, den Abyss zu erkunden. Zusammen mit Reg, einem roboterähnlichen Jungen, begibt sie sich auf eine gefährliche Reise in die Tiefen des Abyss, um ihre Mutter zu finden.

Im Film wird die Geschichte von Nanachi, einer mysteriösen Figur, die im Abyss lebt, weiter ausgeführt. Nanachi ist ein "Hollow", ein Wesen, das durch die verheerenden Auswirkungen des Abyss verändert wurde. Nanachi trifft auf Riko und Reg, nachdem diese in den tieferen Schichten des Abyss auf eine gefährliche Kreatur stoßen. Nanachi bietet ihnen Schutz und hilft ihnen, sich von ihren Verletzungen zu erholen. Dabei wird die tragische Vergangenheit von Nanachi und ihrem Freund Mitty enthüllt, die beide Opfer der grausamen Experimente eines Wissenschaftlers namens Bondrewd wurden.

Der Film konzentriert sich stark auf die Beziehung zwischen Nanachi und Mitty sowie auf die moralischen Dilemmata, die mit den Experimenten im Abyss verbunden sind. Bondrewd, ein skrupelloser Forscher, nutzt die Ressourcen des Abyss, um unmenschliche Experimente durchzuführen, die oft tödliche Konsequenzen haben. Seine Handlungen werfen Fragen über die Grenzen der Wissenschaft und die Ethik der Forschung auf. Riko, Reg und Nanachi müssen sich nicht nur den physischen Gefahren des Abyss stellen, sondern auch mit den emotionalen und moralischen Herausforderungen, die ihre Reise mit sich bringt.

Die Handlung des Films ist geprägt von einer Mischung aus Abenteuer, Tragödie und philosophischen Untertönen. Die Charaktere werden mit schwierigen Entscheidungen konfrontiert, die ihre Entschlossenheit und Menschlichkeit auf die Probe stellen. Der Film vertieft die Welt des Abyss und enthüllt weitere Geheimnisse, die die Zuschauer in die komplexe und oft düstere Mythologie der Serie eintauchen lassen.