Misato Katsuragi ist die Leiterin der Abteilung für taktische Operationen bei NERV, anfangs im Rang eines Hauptmanns und später zum Major befördert. Sie ist für die Koordination der Evangelion-Einheiten im Kampf gegen die Engel verantwortlich. Ihr Hintergrund wird durch die Katsuragi-Expedition geprägt, ein wissenschaftliches Unternehmen unter der Leitung ihres Vaters, das unbeabsichtigt den Second Impact auslöste. Misato war die einzige Überlebende dieser Expedition, gerettet, als ihr Vater sie kurz vor seinem Tod in eine Rettungskapsel setzte. Dieses Ereignis hinterließ bei ihr anhaltende Traumata, ambivalente Gefühle gegenüber ihrem Vater und ein tief verwurzeltes Verlangen nach Rache an den Engeln.

Oberflächlich betrachtet zeigt Misato zwei gegensätzliche Persönlichkeiten. In ihrer beruflichen Rolle ist sie gefasst, entschlossen und strategisch scharfsinnig, führt Operationen mit Selbstvertrauen. In ihrem Privatleben ist sie unorganisiert, trinkt viel Alkohol und neigt zu unreifem Verhalten, lebt in einer unordentlichen Wohnung mit wenig Sinn für Haushaltsordnung. Diese Dichotomie ist ein Bewältigungsmechanismus; sie nutzt eine unbeschwerte und überschwängliche Fassade, um andere auf Distanz zu halten und echte emotionale Nähe zu vermeiden. Hideaki Anno beschrieb sie als jemanden, der das Leben so leicht nimmt, dass er kaum menschliche Berührung zulässt, und sich mit oberflächlichen Beziehungen schützt.

Hinter der sorglosen Maske verbirgt sich ein zutiefst verunsicherter Mensch. Misato kämpft mit Überlebensschuld, unverarbeiteter Trauer um ihren Vater und Angst vor Intimität. Ihre Motivationen sind teils altruistisch – sie möchte die Menschheit wirklich beschützen und sich um die Eva-Piloten kümmern –, rühren aber auch von dem Bedürfnis her, sich ihrem Trauma zu stellen. Sie nimmt Shinji Ikari und später Asuka Langley Soryu bei sich auf und fungiert als deren Vormund. Bei Shinji versucht sie, die Wärme und Stabilität zu bieten, die sie selbst nie hatte, obwohl ihre eigene emotionale Instabilität ihre Bindung oft erschwert. Sie begegnet Asuka mit mütterlicher Geduld, sich des schwierigen Hintergrunds des Mädchens bewusst, selbst wenn Asuka mit Feindseligkeit reagiert.

Misatos romantische Beziehung zu Ryoji Kaji ist zentral für ihre Entwicklung. Sie waren im College ein Paar, aber sie beendete die Beziehung abrupt und gab später zu, dass es daran lag, dass Kaji sie an ihren Vater erinnerte. Sie fürchtete die Implikationen dieser Ähnlichkeit und floh. Während der Serie erneuern sie ihre Beziehung, aber sie bleibt von Spannungen und Unsicherheit geprägt. Nach Kajis Tod wird Misato noch isolierter und ändert ihre Gewohnheit, Bier zu trinken, hin zu Dosenkaffee, was eine Veränderung ihrer Bewältigungsmethoden signalisiert. Im Laufe der Geschichte nutzt sie Sex und Alkohol als Flucht vor Einsamkeit und Realität, ein Muster, das sie während der Instrumentality-Sequenz eingesteht.

Ihre Entwicklung im Laufe der Serie zeigt zunehmende Entschlossenheit und Selbsterkenntnis. Anfangs auf Rache ausgerichtet, wird sie sich allmählich der dunkleren Geheimnisse von NERV und der wahren Natur des Human Instrumentality Projects bewusst. Am Ende der Originalserie und des Films The End of Evangelion geht sie persönliche Risiken ein, um Shinji zu schützen und sich der Verschwörung zu widersetzen, und zeigt die Bereitschaft, sich für die Freiheit anderer zu opfern. Ihre bemerkenswerten Fähigkeiten liegen in strategischer Planung, taktischer Führung unter Druck und der Leitung komplexer Kampfeinsätze. Sie ist auch eine begeisterte Autoliebhaberin und eine geschickte Fahrerin, die häufig ihre Sportwagen nutzt, um durch Tokyo-3 zu navigieren. Misatos Figur verkörpert die Themen der Bewältigung von Traumata, der Schwierigkeit, echte Verbindungen zu knüpfen, und des Kampfes, in einer zerbrochenen Welt einen Sinn zu finden.