"Lovely Complex" ist eine romantische Comedy-Anime-Serie, die auf dem gleichnamigen Manga von Aya Nakahara basiert. Die Handlung dreht sich um die ungewöhnliche Beziehung zwischen Risa Koizumi und Atsushi Ōtani, zwei Highschool-Schülern, die aufgrund ihrer Körpergröße oft im Mittelpunkt von Spott und Aufmerksamkeit stehen. Risa ist mit 172 cm für ein Mädchen ungewöhnlich groß, während Ōtani mit 156 cm für einen Jungen eher klein ist. Diese Diskrepanz führt dazu, dass sie von ihren Mitschülern scherzhaft als "Komedie-Duo" bezeichnet werden.

Die Serie beginnt damit, dass Risa und Ōtani, die in derselben Klasse sind, zunächst nur Freunde sind. Risa hegt jedoch bald Gefühle für Ōtani, der jedoch in eine andere Mitschülerin, Chiharu Tanaka, verliebt ist. Chiharu wiederum interessiert sich für Ōtanis besten Freund, Seiji Suzuki. Diese verworrenen Gefühle führen zu zahlreichen komischen und emotionalen Situationen, während Risa und Ōtani versuchen, ihre Beziehung zueinander zu klären.

Im Laufe der Serie entwickelt sich die Freundschaft zwischen Risa und Ōtani langsam zu einer romantischen Beziehung. Beide müssen jedoch mit ihren eigenen Unsicherheiten und den Erwartungen ihrer Umgebung umgehen. Risa kämpft mit ihrem Selbstbewusstsein, da sie sich oft wegen ihrer Größe unweiblich fühlt, während Ōtani versucht, seine Gefühle für Risa zu verstehen und gleichzeitig seine männliche Identität zu bewahren.

Neben der Hauptgeschichte gibt es auch Nebenhandlungen, die andere Charaktere wie Nobuko Ishihara, Risa's beste Freundin, und Heikichi Nakao, einen weiteren Klassenkameraden, einbeziehen. Diese Nebenhandlungen tragen zur Entwicklung der Hauptcharaktere bei und bieten zusätzliche humorvolle und herzerwärmende Momente.

Die Serie zeichnet sich durch ihren humorvollen und zugleich herzlichen Ton aus, der die Herausforderungen und Freuden jugendlicher Liebe und Selbstfindung einfängt. Die Dynamik zwischen Risa und Ōtani, die sich durch ihre gegensätzlichen Persönlichkeiten und körperlichen Eigenschaften ergibt, bildet das Herzstück der Geschichte und bietet sowohl komische als auch emotionale Höhepunkte.