Academy City wird als Metropole vorgestellt, in der die Mehrheit der Schüler übernatürliche Fähigkeiten besitzt, die als Esper bekannt sind und nach Level eingestuft werden. Die Folge etabliert Mikoto Misaka als eine von nur sieben Level-5-Espern in der Stadt, was ihr den Titel „The Railgun“ einbringt. Ihre Zimmergenossin, Kuroko Shirai, ist eine Level-4-Teleporterin, die bei Judgment, einer von Schülern betriebenen Strafverfolgungsorganisation, dient. Nach ihren Systemscans, die die Esper-Fähigkeiten messen, arrangiert Kuroko, dass ihre Judgment-Kollegin Kazari Uiharu und Uiharus Freundin Ruiko Saten Mikoto treffen. Saten erwartet zunächst, dass Mikoto aufgrund ihres hohen Rangs arrogant ist, stellt aber fest, dass sie freundlich und bescheiden ist. Die vier Mädchen verbringen Zeit zusammen an einem Crêpe-Stand, wo Saten Mikotos Interesse an einem limitierten Gekota-Frosch-Maskottchen bemerkt und ihr das letzte Exemplar gibt. Ihr Ausflug wird unterbrochen, als Uiharu eine Bank beobachtet, deren Sicherheitsschlösser während der Geschäftszeiten geschlossen sind, kurz bevor eine Explosion stattfindet. Drei maskierte Räuber, von denen einer ein pyrokinetischer Esper ist, fliehen vom Tatort. Kuroko greift sofort ein und nutzt ihre Teleportationsfähigkeit, um zwei der Kriminellen zu entwaffnen und zu überwältigen. Während des Chaos vermisst ein kleines Kind aus einer Reisegruppe, und Saten findet ihn in der Nähe der Straße, nur um von dem dritten Räuber getreten zu werden, als dieser versucht, den Jungen als Geisel zu nehmen. Als sie Satens Verletzung sieht, wird Mikoto zum Handeln veranlasst. Während der verbleibende Räuber in einem Auto flieht und direkt auf sie zufährt, nutzt Mikoto ihre Elektromeister-Fähigkeit, um eine Metallmünze aus dem Spielautomaten wie eine Railgun abzuschießen, das Fahrzeug zu zerstören und die Bedrohung zu beenden. Der gefangene Pyrokinetiker erkennt, dass er dem als Railgun bekannten Level-5-Esper gegenübersteht. Anschließend trifft Anti-Skill, die erwachsene Sicherheitstruppe, ein, um die Räuber in Gewahrsam zu nehmen. Ein tragbarer Audioplayer ist in der Tasche des Pyrokinetikers sichtbar, als er abgeführt wird. Saten denkt über die Ereignisse des Tages nach und erkennt die heldenhaften Taten ihrer neuen Bekanntschaften.

Die Episode beginnt damit, dass Misaka einen stachelhaarigen Jungen durch die Stadt jagt, nur um festzustellen, dass ihre Elektromaster-Fähigkeiten durch seine rechte Hand vollständig aufgehoben werden, was sie verwirrt zurücklässt und die Umgebung hinter ihm seltsam unversehrt erscheint. Die Handlung wechselt dann zu einer Alltagsszene im Tokiwadai-Wohnheim, wo Misakas Freunde, Saten und Uiharu, zum ersten Mal ihr Zimmer besuchen. Kuroko, Misakas Zimmergenossin, hat akribisch geplant, was sie als einmonatiges Jubiläum mit Misaka betrachtet, doch ihre romantischen Bestrebungen werden durch die Anwesenheit ihrer Freunde durchkreuzt. Der Konflikt entsteht durch Kurokos obsessive Gefühle für Misaka, die mit Misakas Wunsch nach einer normalen sozialen Interaktion mit ihren neuen Freunden kollidieren, was zu einer Reihe von komödiantischen, aber aufschlussreichen Auseinandersetzungen führt. Die Spannung eskaliert, als Kurokos wahre Absichten durch eine gelieferte Packung Aphrodisiaka aufgedeckt werden, was zu einem heftigen, aber kurzen Esper-Duell zwischen ihrer Teleportation und Misakas Elektrizität führt. Ein entscheidender Wendepunkt tritt ein, als die Wohnheimleiterin eingreift, die Regel gegen den Einsatz von Kräften im Wohnheim strikt durchsetzt und beide Mädchen mit der Aufgabe bestraft, den Schulschwimmbad zu reinigen. Die unmittelbare Folge ihres Zusammenstoßes ist die körperliche Arbeit der Poolreinigung, eine Situation, die sie zu einem vorübergehenden Waffenstillstand zwingt. Während der Arbeit treffen Kurokos Klassenkameraden vom Schwimmteam ein, und ihr Gespräch unterstreicht unbeabsichtigt Misakas beschützende Natur, als ein Mädchen ihr dafür dankt, gegen Schläger eingegriffen zu haben. Die Episode endet damit, dass die Mädchen noch immer bei ihrer Aufgabe sind, und betont, dass sie trotz ihrer mächtigen Fähigkeiten den Regeln und alltäglichen Pflichten des Schülerlebens unterworfen sind. Die Eröffnungsszene mit dem mysteriösen Jungen, der ihre Kräfte aufheben kann, bleibt ein ungelöster Handlungsstrang, der auf einen größeren Konflikt jenseits des Alltags der Schüler hindeutet.

Saten begleitet Uiharu in den Schulbezirk, um Misaka und Shirai zu treffen, aber ein Unfall mit einer Pfütze lässt ihre Uniform durchnässen. Sie leiht sich eine Turnuniform der Tokiwadai-Mittelschule, was sie unbeabsichtigt zum Ziel einer Reihe von Angriffen macht, die im Bezirk stattfinden. Shirai und Uiharu werden zu ihren Judgment-Pflichten gerufen, wo sie von ihrer Vorgesetzten Konori erfahren, dass mehrere Tokiwadai-Schülerinnen mit einem Elektroschocker angegriffen und ihre Gesichter mit Tinte markiert wurden. Die Opfer berichteten, den Angreifer nicht sehen zu können, was auf die Verwendung einer Fähigkeit hindeutet, die die Anwesenheit des Täters verbirgt. Während sie allein in der Cafeteria-Toilette ist, wird Saten vom selben unsichtbaren Angreifer getroffen. Misaka entdeckt ihre bewusstlose Freundin und bringt sie ins Judgment-Büro. Saten kommt wieder zu Bewusstsein und identifiziert die Täterin anhand einer Datenbank als ein Mädchen mit einer markanten Frisur, dessen Spiegelung sie vor dem Angriff in einem Spiegel erhascht hatte. Die Gruppe nutzt das umfangreiche Überwachungsnetzwerk der Stadt, wobei Uiharu den Feed hackt, um die Bewegungen der Verdächtigen zu verfolgen. Misaka und Shirai verfolgen das Mädchen und treiben es schließlich in einem Park in die Enge, wo Misaka es mit einem Elektroangriff außer Gefecht setzt. Die Täterin, eine Level-2-Esper namens Harumi Kiyama, gesteht, dass ihre Motivation aus einer romantischen Zurückweisung durch einen Jungen stammte, der eine Tokiwadai-Schülerin bevorzugte. Sie erklärt, dass ihre Fähigkeit, Dummy Check, es ihr ermöglicht, unsichtbar zu erscheinen, indem sie die Aufmerksamkeit anderer von ihr ablenkt, was während der Angriffe über ihr registriertes Level hinaus funktionierte. Saten sagt, nachdem sie Kiyamas natürliche, dicke Augenbrauen gesehen hat, dass sie diese ansprechend findet – ein Moment unerwarteter Empathie, bevor Anti-Skill eintrifft, um die Täterin in Gewahrsam zu nehmen. Die Lösung des unmittelbaren Falls hinterlässt eine grundlegende Frage, wie die Kraft eines Espers mit einer Stärke auftreten konnte, die ihre offizielle Level-2-Einstufung übersteigt.

Die Folge begleitet Misaka und ihre Freunde bei der Untersuchung verschiedener Stadtlegenden, die in Academy City kursieren. Saten, motiviert durch ihren Status als Level 0, zeigt besondere Begeisterung für das Sammeln von Geschichten über übernatürliche Phänomene und seltene Fähigkeiten. Die Gruppe prüft Gerüchte, darunter eine Wahrsagefähigkeit, die angeblich ermöglicht, das Glück einer anderen Person zu stehlen. Misaka begegnet diesen Erzählungen mit Skepsis und betrachtet sie als haltlose Spekulationen statt als faktische Ereignisse. Die Untersuchung führt die Charaktere an verschiedene Orte in der Stadt, einschließlich einer kurzen Begegnung mit einem Wahrsager, der Saten eine rätselhafte Deutung gibt. Kuroko bleibt auf ihre Pflichten bei Judgment konzentriert und bildet so einen Kontrast zum unterhaltsamen Charakter der Stadtlegendensuche. Die Folge stellt eine Verbindung zwischen den Stadtlegenden und der übergreifenden Handlungsbogen her, als Misako von Gerüchten über Schüler erfährt, die nach Level-Ups zusammenbrechen. Diese Information legt die ersten besorgniserregenden Hinweise auf das Level-Upper-Phänomen, das zukünftige Konflikte antreiben wird. Satens wachsendes Interesse an diesen Gerüchten deutet ihre späteren Entscheidungen bezüglich Fähigkeitssteigerung an. Die Folge balanciert Charakterinteraktionen mit Handlungsentwicklung, zeigt den Alltag der Protagonisten und führt Elemente ein, die bedeutsam werden. Die unmittelbare Folge der Episode ist die Etablierung eines Rätsels, das die Hauptcharaktere zu weiterer Untersuchung veranlasst.

Die Episode dreht sich um einen Konflikt zwischen den Judgment-Mitgliedern Kuroko Shirai und Kazari Uiharu. Während einer Routinepatrouille werden sie Zeugen eines Diebstahls. Kuroko ignoriert Uiharus Rat, auf Verstärkung zu warten, und teleportiert sich in einen Hinterhalt, der den Dieben die Flucht ermöglicht und Uiharu verletzt. Frustriert konfrontiert Uiharu Kuroko mit deren Leichtsinn und ist weiter verärgert, als Kuroko ein bedeutendes Versprechen aus ihrer gemeinsamen Vergangenheit vergessen zu haben scheint. Die Erzählung wechselt dann zu einer Rückblende, die die Ursprünge ihrer Partnerschaft detailliert. Vor einiger Zeit reagierten Kuroko und ihre Vorgesetzte Mii Konori auf einen Banküberfall. Kurokos impulsive Handlungen verschärften die Situation, was dazu führte, dass die junge Uiharu, die lediglich eine Zuschauerin war, als Geisel genommen wurde. Der Räuber, ein Esper, nutzte eine Fähigkeit, die Konori verletzte, als sie Kuroko vor einem weiteren überstürzten Angriff schützte. In Anerkennung der Konsequenzen ihres Verhaltens nutzte Kuroko ihre Teleportation, um Uiharu in Sicherheit außerhalb der Bank zu bringen. Sie entschied sich dann, den verbliebenen Räuber allein zu stellen und die Verantwortung für die von ihr ausgelösten Ereignisse zu übernehmen. Ihr Standhalten war letztendlich erfolgreich dank des anonymen Eingreifens von Mikoto Misaka, die Uiharu um Hilfe gebeten hatte. Nach diesem traumatischen Ereignis gaben Kuroko und Uiharu ein gemeinsames Versprechen, sich selbst treu zu bleiben und gemeinsam vollwertige Judgment-Mitglieder zu werden. Zurück in der Gegenwart erinnert sich Kuroko endlich an dieses Versprechen. Sie entschuldigt sich bei Uiharu und sie versöhnen sich. Gemeinsam spüren sie die Autodiebe, auf die sie zuvor gestoßen waren, auf und nehmen sie fest, wobei sie das Vertrauen demonstrieren, das sie aus ihrer gemeinsamen Geschichte wieder aufgebaut haben.

Nach Kongous Verletzung teilt sich die Episode auf zwei gleichzeitige Schlachten auf. Wannai und Awatsuki stellen Yoshio Baba direkt, um seine Flucht zu verhindern und eine von ihm implantierte Mückendrohne zurückzuholen. Baba setzt robotische Dogge-Drohnen ein, um die beiden Schülerinnen anzugreifen, gestützt auf seine Analyse ihrer Fähigkeiten. Wannai nutzt ihre Hydro-Hand-Fähigkeit, um Wasser aus einem nahen Reservoir zu manipulieren, während Awatsuki ihre Float-Dial-Kraft einsetzt, um die Schwerkraft von Objekten zu verändern. Baba nutzt Wannais scheinbare Grenze, nur drei Wasserströme gleichzeitig zu kontrollieren, und zwingt sie, ihre Vorräte zu erschöpfen, indem sie seine Roboter zerstört. Allerdings enthüllt Wannai, dass sie heimlich einen vierten Strom durch einen Regenwasserkanal geleitet hat, mit dem sie Babas Kopf umhüllt. In Panik befiehlt Baba seinen verbliebenen Drohnen, das Wasser aufzunehmen, was zu einem Kurzschluss führt. Awatsuki neutralisiert seine letzte Mückendrohne, und das Duo holt das intakte Gerät zur Analyse. Unterdessen erklärt Saten in einem Krankenhaus Mikoto die Situation, die die schwer verletzte Kongou auf einer Trage sieht. Mikoto entdeckt ein elektronisches Signal von einer weiteren Mückendrohne, die in Kongous Haar versteckt ist, und beschlagnahmt sie. Von Wut getrieben verlässt sie das Krankenhaus und nutzt das Leitsignal der Drohne, um Baba zu seinem Überwachungswagen zu verfolgen. Bevor sie eintrifft, setzt Baba einen großen Gottesanbeterinnen-Roboter frei, da er Mikoto für eine der Sisters hält. Mikoto zerstört die Maschine mühelos und kündigt über ihr Kommunikationssystem ihre Anwesenheit an. Da Mikotos elektromagnetische Kontrolle ihn in seinem Wagen einschließt, wird Baba von ihr konfrontiert. Mikoto warnt ihn, seine Aktionen einzustellen, verschont ihn aber aufgrund von Ungewissheit über seine Verbindung zu dem Mädchen, das die Sisters kontrolliert. Die Episode endet damit, dass das Mädchen mit dem Schädelanhänger, in Lila gekleidet, einen Bericht über Babas Scheitern erhält. Sie beschließt, die Situation persönlich zu regeln, trotz einer Warnung ihrer braunhaarigen Begleiterin vor Mikotos Fähigkeiten.

Die Folge treibt die Handlung um den Gravitonenbomber voran, als Kuroko und Konori erkennen, dass die Judgment-Beamten selbst die beabsichtigten Ziele sind und nicht zufällige Opfer. Diese Erkenntnis verlagert den Fokus der Untersuchung und erzeugt sofortige Dringlichkeit, als eine neue Bombensignatur im Einkaufszentrum Seventh Mist, wo sich Uiharu aufhält, entdeckt wird. Gleichzeitig entwickelt sich Saten's Nebenhandlung durch ihr Gespräch mit Mikoto, in dem sie Gefühle der Unzulänglichkeit wegen ihres Mangels an Esper-Kräften äußert und die urbane Legende des Level Upper erwähnt. Ihr Lachen nach diesen Bemerkungen verbirgt ihre zugrunde liegende Frustration, nicht wie ihre Freunde beitragen zu können, nicht vollständig. Der Einkaufsbummel bietet eine vorübergehende Ablenkung, bis die Bombendrohung eine Evakuierung erzwingt. Ein kleines Mädchen nähert sich Uiharu mit einem Stofftierfrosch, der im Auftrag eines Mannes mit Brille übergeben wird und beginnt, einen Gravitonenkollaps zu zeigen. Uiharu wirft das Spielzeug weg und schützt das Kind. Mikoto versucht, die Bombe mit ihrer Railgun zu zerstören, lässt jedoch ihre Arcade-Münze fallen, was den Schuss verhindert. Die Explosion erfolgt, doch niemand wird verletzt. Nach dem Vorfall lokalisiert und konfrontiert Mikoto den Täter, einen gemobbten Jungen namens Kaitabi, der seine wachsenden Kräfte aus Groll über ihr Versagen, ihn zu schützen, nutzt, um Judgment anzugreifen. Er versucht einen weiteren Angriff, wird aber überwältigt, als Mikoto seine Waffe verdampft. Kuroko teilt ihm mit, dass Mikoto selbst sich durch Anstrengung von Level 1 zu Level 5 hochgearbeitet hat und dass sie ihn unabhängig von ihrem Kraftniveau aufgehalten hätte. Die Folge endet damit, dass Mikoto Kamijou privat zugesteht, dass sein Eingreifen, nicht ihres, Opfer verhindert hat, auch wenn er die Bedeutung der Anerkennung herunterspielt.

Die Episode beginnt damit, dass Uiharu Kazari wegen Krankheit nicht in der Schule erscheint, was ihre Freundin Saten Ruiko veranlasst, nach dem Unterricht Medizin vorbeizubringen. Diese persönliche Angelegenheit bildet den Hintergrund für den zentralen Konflikt, als sich die Freundinnen in Uiharus Wohnheimzimmer versammeln und die laufende Untersuchung des Graviton Bombers, Kaitabi Hatsuya, besprechen. Misaka Mikoto und Shirai Kuroko geben ihre Verwirrung darüber preis, wie ein angeblich Level 2 Kräfte einsetzen kann, die einem Level 4 entsprechen, was ihr Interesse an der urbanen Legende des Level Upper neu entfacht. Saten bestätigt das Fortbestehen des Gerüchts online und identifiziert mit Uiharus Hilfe ein Forum, in dem Nutzer über das Programm diskutieren. Motiviert vom Wunsch, die Diskrepanz in Kaitabis Fall zu verstehen, beschließt Mikoto, den Level Upper aus erster Hand zu untersuchen, wobei Kuroko sie aus Sorge begleitet. Ihre Untersuchung führt sie in ein Restaurant, in dem angebliche Nutzer des Level Upper verkehren. Mikoto, die versucht, durch einen verdeckten Ansatz Informationen zu sammeln, gibt sich verzweifelt und kindisch, um die Wachsamkeit der anwesenden älteren Jugendlichen zu senken. Ihr Auftritt ist ein kalkulierter Konflikt, ein Wendepunkt, an dem sie Täuschung statt Konfrontation wählt, um in die Gruppe einzudringen. Die unmittelbare Folge dieses Wagnisses ist, dass einer der Männer Interesse an ihr zeigt und andeutet, dass die Informationen vielleicht nicht kostenlos seien, wodurch die Spannung der Begegnung eskaliert. Unterdessen verstärkt die Episode Satens inneren Konflikt bezüglich ihres eigenen Status als Level 0. Ihr Gespräch mit der bettlägerigen Uiharu offenbart ihren Kampf, das Konzept der Personal Reality zu begreifen, und ihre leise, unterschwellige Hoffnung, dass ein Werkzeug wie der Level Upper ihre Fähigkeiten tatsächlich steigern könnte. Die Erzählstränge konvergieren auf die Existenz des Level Upper als greifbares, wenn auch mysteriöses Programm und bereiten die Bühne für seine mögliche Verbindung zum komatösen Zustand von Kaitabi und anderen. Die Episode stellt klar, dass das Streben nach Macht durch künstliche Mittel unbekannte Risiken birgt, da die Untersuchung des Level Upper sich von einem Gerücht zu einer konkreten Bedrohung mit realen Opfern wandelt.

Mikoto und Misaki setzen ihre Verfolgung von Gensei Kihara mit unterschiedlichen Methoden fort, wobei Misakis Team ihn in einer Einrichtung aufspürt und zu ergreifen versucht. Gensei entzieht sich vorübergehend der Festnahme durch einen Doppelgänger, eine Täuschung, die offensichtlich wird, als er kurz darauf telefonierend gesehen wird. Die Folge enthüllt, dass das Mädchen, das zuvor Uiharu und Misuzu entführt hat, Mitori Kozaku heißt, eine ehemalige Schülerin einer Besserungsanstalt, die offiziell für tot erklärt wurde, nun aber in der Stadt aktiv ist. Kuroko und Uiharu untersuchen Mitoris Hintergrund in einem Archiv und decken ihre Geschichte terroristischer Aktionen auf, was Fragen darüber aufwirft, wer ihre Freilassung ermöglichte und zu welchem Zweck. Saten ermittelt unabhängig in einer möglichen Spur in einer verlassenen Fabrik und trifft unterwegs auf Touma, der an einer Schnitzeljagd teilnimmt, wodurch die Ereignisse dieser Folge zeitlich nach einem bestimmten Vorfall in A Certain Magical Index II eingeordnet werden. Die Untersuchung deutet darauf hin, dass Mitori möglicherweise nicht direkt für Gensei arbeitet, was Unklarheit über ihre wahren Ziele und Loyalitäten schafft. Misaki zeigt ein ungewöhnliches Maß an Besorgnis beim Schutz ihrer Operationsbasis, wo der Klon 10032 genesen soll, und deutet auf eine weitere bedeutende Ressource hin, die dort unter dem Codenamen „Exterior“ verborgen ist. Die Folge baut auf eine Rückblendesequenz im nächsten Teil hin, der den Titel „Clone Dolly“ trägt und eine jüngere Misaki mit einer Person zu zeigen scheint, die einem Misaka-Klon stark ähnelt.

Ruiko Saten erlebt zum ersten Mal die Freude, eine Esper-Kraft auszuüben, indem sie eine geringe Windmanipulationsfähigkeit nutzt, die ihr durch den Level Upper verliehen wurde. Ihre Begeisterung steht in scharfem Kontrast zur laufenden Untersuchung, während die Mitglieder von Judgment einer Welle von außer Kontrolle geratenen Nutzern gegenüberstehen. Kuroko Shirai bewältigt zahlreiche Festnahmen eigenhändig und erleidet erhebliche Prellungen und Erschöpfung durch die unablässigen Begegnungen. Mikoto Misaka und Kuroko stellen die Hypothese auf, dass der Level Upper möglicherweise durch Synästhesie funktioniert und Gehirnwellen über akustische Eingaben manipuliert. Ihre Theorie gewinnt an Bedeutung, als Dr. Harumi Kiyama vorschlägt, den Tree Diagram-Supercomputer zur Analyse zu konsultieren. Der zentrale Konflikt der Episode verlagert sich, als einer von Satens Freunden nach der Nutzung der Kraft in ein Koma fällt. Eine panische Saten gesteht Kazari Uiharu ihre Beteiligung und macht sich selbst für die ernste Situation verantwortlich. Uiharu gibt ein leidenschaftliches Versprechen, immer an Satens Seite zu stehen, unabhängig von ihrem Esper-Level, bevor sie zu ihrer Wohnung eilt. Sie trifft ein und findet Saten bewusstlos auf dem Boden, wie sie ihr Glücksamulett umklammert – ein Opfer genau des Phänomens, das sie untersuchten. Im Krankenhaus enthüllt ein Arzt, dass alle komatösen Patienten identische, abnormale Gehirnwellenmuster aufweisen. Eine Datenbanksuche nach einem passenden Muster ergibt eine einzige, nahezu perfekte Übereinstimmung: Dr. Kiyama selbst. In einer parallelen Entwicklung entdeckt Uiharu, die in Kiyamas Büro wartet, versteckte Forschung über Synästhesie, was zu ihrer Gefangennahme durch die Ärztin führt. Während Anti-Skill mobilisiert wird und Kuroko verletzt ist, beschließt Mikoto, Kiyama persönlich gegenüberzutreten, die nun Uiharu als Geisel hält.

Nachdem sie in das AIM-Burst-Netzwerk gezogen wurde, verbindet sich Misaka direkt mit dem Bewusstsein von Dr. Kiyama und wird Zeugin ihrer Erinnerungen. Dies enthüllt die Motivation der Ärztin für die Entwicklung des Level-Upper-Programms: Sie versucht, ihre Schüler wiederzubeleben, eine Klasse von Child Errors, die seit einem früheren Experiment im Koma liegen. Der Erzählfokus wechselt zur außer Kontrolle geratenen AIM-Burst-Entität, die sich aus dem kollektiven Unbewussten der komatösen Kinder und der Level-Upper-Nutzer manifestiert. Misaka stellt sich dieser mächtigen Kreatur gegenüber, die durch das Netzwerk am Leben erhalten wird, das sie unbeabsichtigt gestärkt hat. Uiharu spielt trotz ihrer niedrigen Fähigkeiten eine entscheidende Rolle, indem sie ihre Datenmanipulationsfähigkeiten nutzt, um den Vormarsch der Kreatur zu verlangsamen. Der Konflikt eskaliert, als die Kreatur droht, ein Kernkraftwerk zu erreichen, was die Gefahr für die gesamte Stadt erhöht. Misaka beschließt schließlich, die Entität zu stoppen, indem sie ihre Railgun einsetzt, um das Gerät in ihrem Kern zu zerstören, wobei sie das enorme Risiko versteht. Die Episode gipfelt in der Zerstörung der Kreatur und dem Zusammenbruch des Level-Upper-Netzwerks, wodurch alle Nutzer, einschließlich Saten, ins Koma fallen. Im Nachhinein erfahren Misaka und die anderen die Wahrheit über Dr. Kiyamas Absichten und deuten ihre Handlungen als fehlgeleiteten Versuch, ihre Schüler zu retten, anstatt als bloße Boshaftigkeit.

Die Untersuchung des Level-Upper-Phänomens erreicht einen kritischen Punkt, als Misaka Mikoto und ihre Freunde dessen Ursprung auf eine Website zurückverfolgen, die von einer Organisation namens Skill-Out betrieben wird. Gleichzeitig mit dieser Entdeckung taucht eine neue und mächtige Esper, Kiyama Harumi, als direkte Bedrohung auf. Kiyama, eine ehemalige Forscherin, die an einem eingestellten Projekt beteiligt war, das Esper-Gehirnwellen veränderte, wird als Quelle eines mächtigen Energiefelds identifiziert, bekannt als AIM Burst, das sie nutzt, um ihre eigenen Fähigkeiten zu verstärken. Die Folge zeigt die Konfrontation zwischen Misaka und ihren Gefährten gegen Kiyama, bei der sie ihre jeweiligen Kräfte einsetzen, um sie zu bezwingen und die Auswirkungen des AIM Burst zu stoppen. Ihre vereinten Anstrengungen schwächen Kiyama erfolgreich und bringen den unmittelbaren Konflikt zum Abschluss. Die Lösung des physischen Kampfs weicht jedoch einer komplexeren Enthüllung. Es wird deutlich, dass Kiyamas Handlungen nicht völlig autonom waren; stattdessen wurde sie von einer schattenhaften, unbekannten Organisation manipuliert. Diese Entdeckung stellt die vorangegangenen Ereignisse in einen neuen Kontext und verlagert das Ziel der Untersuchung von einem einzelnen Antagonisten zu einer größeren, obskureren Verschwörung innerhalb der Akademischen Stadt. Die Folge endet damit, dass Misaka und ihre Freunde diese neue Komplexitätsebene anerkennen und den Weg für eine tiefere Untersuchung der geheimen Kräfte hinter dem Level Upper und der Manipulation von Kiyama Harumi ebnen. Die unmittelbare Konsequenz der Folge ist ein Wechsel von der direkten Konfrontation hin zu einer investigativen Verfolgung eines unsichtbaren Feindes.

Die Mitglieder des Schwimmclubs der Tokiwadai-Mittelschule, Awatsuki Maaya und Wannai Kinoho, rekrutieren Misaka Mikoto und Shirai Kuroko als Models für eine Bikini-Fotosession, die von einem Designer gesponsert wird. Später gesellen sich Uiharu Kazari, Saten Ruiko, Konori Mii und Kongou Mitsuko zur Gruppe für den Auftrag. Bei der Ankunft in einem Hightech-Studio wählen die Mädchen aus verschiedenen Badeanzugstilen, wobei die Interaktionen ihre unterschiedlichen Persönlichkeiten und Dynamiken hervorheben, einschließlich Kongous Wettbewerbsbewusstsein gegenüber Kuroko und ihrer Unkenntnis über Mikotos Identität als das "Ass" von Tokiwadai. Die Fotosession findet in einem Studio statt, das mit fortschrittlichen holografischen Projektoren ausgestattet ist, die verschiedene Umgebungen und taktile Empfindungen simulieren können. Eine kleine Störung im holografischen System führt dazu, dass die projizierten Szenen unkontrolliert wechseln, was eine Pause der Aufnahmen veranlasst. Während dieser Unterbrechung arbeiten die Gruppenmitglieder zusammen, um eine Mahlzeit zuzubereiten, und entscheiden sich schließlich für Curryreis. Kongou Mitsuko, die mit ihren Kochkünsten geprahlt hatte, hat erhebliche Schwierigkeiten beim Kochen, was ihre völlige Unerfahrenheit offenbart. Sie nimmt Hilfe der anderen an, und die gemeinsame Anstrengung führt zu einer gelungenen Mahlzeit, die ein Gefühl der Kameradschaft fördert und einen Wendepunkt in Kongous zuvor antagonistischen Beziehungen zur Gruppe markiert. Nach Abschluss der Arbeit bleibt Mikoto zurück, um privat den verspielten Zweiteiler-Badeanzug anzuprobieren, den sie sich zuvor aus Schüchternheit nicht ausgesucht hatte. Als sie das Studio betritt, aktiviert sie versehentlich das Anzeigesystem, das ihr Bild auf einen großen Außenmonitor projiziert, genau in dem Moment, als Touma Kamijou vorbeikommt und den peinlichen Moment beobachtet.

Während Misaka und Shirai besprechen, wie sie ihren freien Tag verbringen sollen, meldet sich Saten zu einem speziellen Workshop an einer anderen Schule. Die Sitzung ist verpflichtend für Schüler, die zuvor das Level-Upper-Gerät benutzt haben. Die Teilnehmer werden von Tsukuyomi Komoe unterrichtet, die ihnen die Theorie der Entwicklung der persönlichen Realität als Grundlage für Esper-Fähigkeiten erklärt. In der Mittagspause trifft Saten auf Jufuku Miho, ein schüchternes Mädchen aus der Level-Upper-Selbsthilfegruppe, das ihr Briefe geschrieben hatte. Miho, dankbar für Satens frühere Freundlichkeit, bietet an, ihr Essen zu teilen, was die anhaltende Verbindung zwischen ehemaligen Nutzern zeigt. Die Nachmittagssitzung unter der Leitung von Yomikawa Aiho besteht aus anstrengendem körperlichem Training, das den Schülern beibringen soll, ihre wahrgenommenen Grenzen zu überwinden. Eine Teilnehmerin, ein zuvor von Misaka zur Rede gestelltes delinquentes Mädchen, beschuldigt die Ausbilder, Bestrafung als Bildung zu tarnen. Saten widerspricht dieser Behauptung und betont, dass die Teilnehmer die Konsequenzen selbst verursacht hätten, indem sie versuchten, das System zu betrügen. Komoe klärt später auf, dass der Workshop keine Bestrafung, sondern eine Chance sei, und erklärt, dass die Erfahrung einer höheren Machtstufe durch Level Upper ihnen ein greifbares Ziel gebe, auf das sie auf legale Weise hinarbeiten können. Die Episode endet mit Fähigkeitstests, die geringe Verbesserungen bei den Schülern zeigen, und Saten findet einen ermutigenden Brief von Miho in ihrem Schuhfach, der ihren Entschluss stärkt. Sie geht hinaus und findet ihre Freunde, die auf sie gewartet haben, nachdem sie den Tag damit verbracht hatten, ohne sie keine Aktivität entscheiden zu können.

Die Folge führt einen neuen Konflikt ein, der sich um eine Gruppe von Level 0-Espern namens Skill-Out dreht. Kongou Mitsuko wird von Mitgliedern einer Skill-Out-Bande namens Big Spider angegriffen, wird jedoch von einem mysteriösen rothaarigen Mann mit einer Spinnentätowierung auf dem Rücken gerettet, bevor sie aufgrund einer seltsamen Kopfschmerzattacke das Bewusstsein verliert. Konori Mii von Judgment reagiert mit sichtbarem Wiedererkennen, als sie die Beschreibung des Mannes und den Namen der Bande hört, was auf eine persönliche Verbindung hindeutet. Uiharus Recherchen ergeben, dass der Anführer von Big Spider Kurozuma Wataru heißt und ihre Operationsbasis im 10. Bezirk der Akademischen Stadt liegt, einem heruntergekommenen Viertel mit dem Spitznamen 'Strange'. Misaka und Kuroko reisen in den 10. Bezirk, um zu ermitteln. Sie werden von örtlichen Schlägern konfrontiert, aber erneut von demselben rothaarigen Mann gerettet, der die Angreifer mühelos besiegt, nachdem sie ihm seine Milch wegschlagen. Der Mann spricht von dem Bezirk als einem Ort für diejenigen, die vom städtischen Level-System verworfen wurden, weigert sich jedoch, Informationen über Big Spider oder Kurozuma preiszugeben. Später verfolgen Misaka und Kuroko Big-Spider-Mitglieder zu ihrem Versteck und konfrontieren den Mann, der behauptet, Kurozuma zu sein. Die Bande aktiviert ein Gerät namens 'Capacity Down', das einen Ton aussendet, der die Fähigkeiten von Espern stört und die beiden machtlos und verwundbar zurücklässt. Der rothaarige Mann trifft ein und zerstört das Gerät, wodurch er den Vorteil der Bande außer Kraft setzt. Er entlarvt den Anführer als Hebitani und gibt sich selbst als der echte Kurozuma Wataru zu erkennen. Nachdem er die Bandenmitglieder im Alleingang besiegt hat, trifft Konori Mii am Ort des Geschehens ein, und ihre Haltung bestätigt eine frühere Bekanntschaft mit dem echten Kurozuma, was Misaka und Kuroko über die Verbindung überrascht zurücklässt.

Nach der Konfrontation auf dem Dach entzieht sich Konori Mii ihren Pflichten im Judgment-Büro, was Besorgnis bei ihren Kollegen auslöst. Misaka Mikoto, Shirai Kuroko, Saten Ruiko und Uiharu Kazari suchen Konoris Wohnheim auf, um nachzuforschen, wo sie ihre Mitbewohnerin Aomi treffen. Aomi enthüllt, dass Konori in einer schwierigen Phase ihrer Vergangenheit, als sie mit ihrer Esper-Entwicklung kämpfte und einen Ort der Zugehörigkeit suchte, einst Mitglied der Skill-Out-Gang Big Spider war. Die Erzählung zeigt, dass die Gang ursprünglich eine harmlose Gruppe von Level 0s war. Anti-Skill plant daraufhin eine großangelegte Razzia im Slum von Distrikt 10, um gegen Big Spider vorzugehen. Bei einer Konfrontation mit Konori auf einem Dach erfährt Misaka die ganze Geschichte: Vor zwei Jahren wurde Big Spiders Stellvertreter Hebitani Tsuguo als Geisel genommen, was den Gang-Anführer Kurozuma Wataru dazu veranlasste, in eine Falle zu tappen, um ihn zu retten. Eine Explosion schien Kurozuma zu töten, obwohl er tatsächlich schwer verletzt überlebte und Jahre der Rehabilitation durchlief. Kurozuma taucht wieder auf und erklärt seine Absicht, die korrumpierte Big Spider selbst aufzulösen. Konori, die betont, dass ihre Gefühle für ihn trotz ihrer Position in Judgment unverändert sind, beschließt, sich einzumischen. Am Tag der Anti-Skill-Razzia zieht Konori ihre alte rote Lederjacke an und wird von Misaka und Kuroko begleitet, die ihr eine Judgment-Armbinde anlegen. Die drei verfolgen Kurozuma zum Big Spider-Versteck, wo er zahlreiche Gangmitglieder im Nahkampf bekämpft. Hebitani befiehlt seinen Männern zu schießen, aber ihre Waffen werden durch Kurokos Teleportationspfeile außer Gefecht gesetzt, und Misaka zerstört das im Raum vorhandene Capacity Down-Gerät. Nachdem Kurozuma die verbleibenden Schläger besiegt hat, droht Hebitani mit der Zündung einer Sprengstoffweste – ein Bluff, den Kurozuma sofort durchschaut, bevor er ihn außer Gefecht setzt. Nach der Niederlage der Gang verlässt die Gruppe das Gebäude, um auf Anti-Skill zu warten. Kurozuma ergibt sich formell Konori, die ihn unter Verdacht der Körperverletzung festnimmt – ein Moment, der durch einen kurzen, persönlichen Austausch zwischen ihnen aufgelockert wird. Die Episode endet mit Misaka und Kuroko auf einem Dach, die darüber nachdenken, dass persönliche Bindungen trotz bedeutender Veränderungen im Leben und in den Umständen der Menschen bestehen bleiben können.

Die Episode konzentriert sich auf Tsuzuri Tessou, eine gut gemeinte, aber oft ineffektive Anti-Skill-Beamtin und Lehrerin. Nach einer Reihe frustrierender Misserfolge während ihrer Streifendienste schlagen ihre Kolleginnen Aiho Yomikawa und Komoe Tsukuyomi vor, dass sie ein Hobby braucht, um ihren Stress abzubauen und ihre Leistung zu verbessern. Dieser Rat veranlasst Tsuzuri, ein Kindheitsinteresse wiederaufzunehmen: ein altes Arcade-Kampfspiel mit dem Titel "Gekisho 9". In der Spielhalle trifft sie wiederholt auf einen Mittelschüler namens Haruki Konoue, einen Klassenkameraden von Kazari Uiharu und Ruiko Saten, der ebenfalls danach strebt, dasselbe Spiel zu meistern. An ihrem freien Tag bringt sie ihm impulsiv bei, wie man einen Geheimcharakter freischaltet, bevor sie weggerufen wird, um einer betrunkenen Yomikawa zu helfen. Ein darauf folgender Diensttag bringt eine Reihe ungewöhnlicher Vorfälle mit sich, darunter Begegnungen mit einer silberhaarigen Nonne (Index) und einer Schreinmädchen (Aisa Himegami), die als Kontinuitätsverweise auf das größere Universum dienen. Zu ihren Aufgaben gehört auch, einem abgelenkten Mädchen bei der Suche nach einem verlorenen Anhänger zu helfen. Als sie am Abend in die Spielhalle zurückkehrt, wird Tsuzuri von Konoue zu einem Match herausgefordert, der den Geheimcharakter gemeistert hat und nun ein beeindruckender Gegner ist. Nach ihrem Spiel begleitet sie ihn nach Hause, und er bietet einen einfachen, unbeholfenen Ausdruck der Dankbarkeit an. Tage später erfährt Tsuzuri von Uiharu und Saten, dass Konoue auf eine Schule gewechselt ist, die sich auf Spieldesign spezialisiert und von den Schöpfern von "Gekisho 9" gesponsert wird. Die Erkenntnis, dass ihre kleine Anleitung ihn dazu inspiriert hat, einen konkreten Traum zu verfolgen, gibt Tsuzuri ein erneuertes Gefühl von Sinn und Zufriedenheit in ihrer eigenen Rolle.

ITEM führt einen Auftrag gegen eine Gruppe von Mechs unter der Aufsicht einer mysteriösen Organisation aus. Die Episode verlagert dann den Fokus auf das Privatleben der Hauptcharaktere, während sie sich auf Banris Entlassung aus dem Krankenhaus vorbereiten. Erii wird aus Uiharus Wohnung ausziehen, um mit Banri zusammenzuleben, was eine Reihe von Emotionen innerhalb der Freundesgruppe auslöst. Der bevorstehende Umzug schafft eine ergreifende Nebenhandlung, die sich auf Uiharu und Erii konzentriert und die Stärke ihrer Bindung als Mitbewohnerinnen hervorhebt. Unterdessen werden Kuroko und Uiharu aufgrund eines stadtweiten Ausfalls der Verkehrssignale zu Judgment-Diensten gerufen, was auf größere, zugrunde liegende Ereignisse hindeutet. Mitsuko Kongo nutzt ihre Fähigkeit, um einen Handtaschendieb aufzuhalten, wird jedoch anschließend von einem unbekannten Mann für ihre Handlungen gerügt, was auf die Präsenz unsichtbarer Kräfte hindeutet, die die Stadt beobachten. Nach Abschluss ihrer Pflichten schenkt Uiharu Erii eine Schachtel Taiyaki als Andenken und erinnert sich dabei besonders an den Tag, an dem Erii ihr erstmals ihre Fähigkeit offenbarte. Die beiden verabschieden sich emotional, da ihre Zeit als Mitbewohnerinnen endet. Als die Gruppe auf dem Heimweg einen Umweg nimmt, entdecken sie ein mysteriöses weißhaariges Mädchen namens Febri, das in einem Blumenbeet schläft und Misaka wiederzuerkennen scheint. Diese Begegnung leitet einen neuen Handlungsbogen ein, während die Episode gleichzeitig die mysteriöse Organisation zeigt, die ihren nächsten Plan initiiert, um ihre Macht gegen Esper zu demonstrieren.

Das Tokiwadai-Wohnheim veranstaltet sein jährliches Mittsommerfest und öffnet seine Türen für eingeladene Gäste zu verschiedenen Ausstellungen und Veranstaltungen. Mikoto Misaka ist für eine Bühnenaufführung eingeteilt und kämpft mit wachsender Nervosität, als sich Gerüchte über ihren Auftritt unter den Besuchern verbreiten. Kuroko Shirai wird von Maika Tsuchimikado zur Küchenarbeit eingezogen, sodass Mikoto ihre Freundinnen Ruiko Saten und Kazari Uiharu über das Festgelände führen muss. Die Tour umfasst verschiedene Attraktionen, und die Besucher erfahren von Mikotos bevorstehendem Solo, was ihre Vorfreude steigert und unbeabsichtigt ihre Angst verstärkt. Kinder aus dem Asunaro Park, begleitet von der Wohnheimleiterin, äußern ihre Begeisterung für die Aufführung, was den Druck auf Misaka weiter erhöht. Während der Vorbereitung hinter der Bühne trifft Mikoto auf Touma Kamijou, der eine verlorene Bekannte sucht. Misaka deutet seine Anwesenheit fälschlicherweise als Versuch, sie zu verspotten, und reagiert mit heftiger Wut, indem sie ihn vertreibt. Dieser Ausbruch löst effektiv ihre angestaute Auftrittsangst. Befreit von ihrer Nervosität betritt Mikoto die Bühne und führt ein gekonntes Violinensolo von Elisa's "Real Force" auf, das das Publikum fesselt. Die Folge endet mit dem Ausklang des Festes und hebt die Lösung von Mikotos persönlichem Konflikt und ihren erfolgreichen Auftritt hervor.

Die Folge setzt die Verfolgung von Saten Ruiko fort, die nach einem früheren Entführungsversuch unter Frendas Schutz gestellt wurde. Frenda wird von einem unsichtbaren Scharfschützen angeschossen, während sie mit Saten spricht, was sie zwingt, in einem überfüllten Kaufhaus Deckung zu suchen. Die Angreiferin ist Yumiya Rakko, ein Mitglied der Organisation SCHOOL, die das Paar systematisch durch das Gebäude verfolgt. Frenda stellt fest, dass ihre üblichen Taktiken wirkungslos sind, da Rakko ihre Bewegungen ständig vorhersagt und ihre Ablenkungsversuche durchschaut. Saten erkennt, dass ihre Machtlosigkeit sie zur Belastung macht, und bietet sich freiwillig als Köder an, um die Jägerin zu enttarnen. Saten geht direkt auf Rakko zu, während sie explosive Puppen trägt, was Rakko zwingt zu reagieren und ihre Position für Frenda preiszugeben. Frenda verwickelt Rakko in einen Nahkampf und setzt eine thermobarische Explosion ein, um den Sauerstoff im unmittelbaren Bereich zu verbrauchen. Als Rakko zu einem zerbrochenen Fenster für Luft flüchtet, wartet Frenda bereits und schleudert sie mit Sprengstoff aus dem Gebäude. Saten wird anschließend zum Schutz in die Obhut von Anti-Skill gegeben. Im Nachhinein nutzt SCHOOLs Anführer, Kakine Teitoku, die Informationen aus Rakkos Mission, um den Standort des „Tweezers“-Ziels zu identifizieren. Rakko überlebt die Explosion und äußert den Wunsch nach Rache an Frenda, aber Kakine weist sie zugunsten der Verfolgung ihres Hauptziels zurück. Eine Woche später wartet Saten auf einen versprochenen Besuch von Frenda, doch stattdessen erscheint Uiharu Kazari mit einem verletzten Arm an ihrer Tür, was darauf hindeutet, dass Frenda ihr Versprechen nicht einhalten kann.

Nach einem Poltergeist-Vorfall im Park wird die Untersuchung der Erdbeben intensiviert. Mikoto und Kuroko führen eigenmächtig eine illegale Hintergrundüberprüfung von Haruue Erii durch, der Austauschschülerin, die bei Uiharu wohnt. Ihre Recherche ergibt, dass Haruue als Telepathin der Stufe 2 registriert ist, aber offizielle Vermerke deuten darauf hin, dass ihre Fähigkeit bei bestimmten Wellenlängen über ihr Level hinausgehende Kraft entfalten kann. Diese Information schürt Kurokos Verdacht, dass Haruue unfreiwillig die Ursache der zerstörerischen Phänomene sein könnte. Unterdessen nimmt Uiharu Haruue in einen Park mit, um ihr Trost und Ablenkung von ihrer Not zu bieten. Während ihres Ausflugs offenbart Haruue, dass sie einen längst verlorenen Kindheitsfreund sucht. Der Moment der Ruhe wird jäh zerstört, als Haruue plötzlich in Trance fällt und vor sich hin murmelt, was einem weiteren starken Poltergeist-Ereignis in der unmittelbaren Umgebung vorausgeht. Uiharu erleidet bei dem Vorfall leichte Verletzungen, was den Konflikt vertieft, als Kuroko sie mit Haruues möglicher Beteiligung konfrontiert. Uiharu verteidigt ihre neue Freundin vehement, was zu einem seltenen und heftigen Streit zwischen den beiden Mitgliedern von Judgment führt. Um den Disput beizulegen, schlägt Forscherin Therestina Kihara Lifeline vor, Haruue in der MAR-Einrichtung zu untersuchen, um ihre Verbindung zur AIM-Feld-Interferenz festzustellen. Die Tests ergeben, dass Haruue nicht für die Störungen verantwortlich ist, ein Befund, der sie zunächst zu entlasten scheint. Beim Aufwachen erklärt Haruue, dass sie in Trance fällt, wenn sie die Stimme ihres vermissten Freundes Edasaki Banri hört. Als sie der Gruppe ein Foto zeigt, erkennt Mikoto Edasaki sofort als eines der Child Errors, die Schüler von Kiyama Harumi waren, der Anstifterin des Level Upper-Vorfalls. Haruue enthüllt daraufhin, dass sie selbst ebenfalls ein Child Error ist, eine Enthüllung, die ihre Situation neu kontextualisiert und die aktuelle Krise mit vergangenen Ereignissen in Academy City verbindet.

Erii erklärt Misaka und ihren Freunden, dass sie und Banri beide Telepathen sind, die zusammen in einer Child-Error-Einrichtung aufgewachsen sind, bevor Banri verlegt wurde, und dass sie in letzter Zeit Banris telepathische Hilfeschreie hört. Uiharu versucht, Erii zu trösten, indem sie ihr Taiyaki bringt und ihre eigene Fähigkeit, Thermale Hand, offenbart, die es ihr ermöglicht, die Temperatur von Objekten, die sie berührt, zu halten. Spannungen entstehen unter den Freunden, als Uiharu erfährt, dass Banri eines der komatösen Kinder aus Kiyamas Experiment sein könnte und Kurokos Hilfsangebot kalt ablehnt. Kurokos Recherchen decken Kihara Genseis theoretische Arbeit auf, die davor warnt, dass gleichzeitige Resonanz von AIM-Feldern mehrerer komatöser Esper ein Erdbeben erzeugen könnte, das stark genug ist, um Academy City zu zerstören. Basierend auf dieser Information dringt Misaka in eine von Kiharas verlassenen Einrichtungen ein und trifft auf Kiyama, die sie zu einer geheimen Krankenstation führt, in der alle zehn komatösen Child Errors von Heaven Canceller betreut werden. Heaven Canceller enthüllt, dass er Kiyamas Freilassung arrangiert und die Kinder gesammelt hat, um eine Behandlung zu entwickeln, und erklärt, dass Kihara Gensei aus extrahierten Esper-Gehirnchemikalien Ability Crystals geschaffen hat, um einen Level 6 oder SYSTEM zu erschaffen, wobei die Child Errors als Versuchspersonen dienten. Kiyama gibt zu, dass sie die Poltergeist-Vorfälle durch ihre Versuche verursacht, die Kinder wiederzubeleben, deren Kräfte außer Kontrolle geraten, sobald sie dem Bewusstsein nahekommen, und gesteht, dass sie sie ungeachtet der möglichen Zerstörung aufwecken wird. Therestina trifft mit MAR-Einheiten und einem Haftbefehl ein und fordert das Sorgerecht für die Kinder zum Schutz der Stadt. Misaka entscheidet sich, Therestina zu unterstützen, weist darauf hin, dass Kiyamas Methoden niemanden retten konnten, und informiert Kiyama über Banris leidvolle Schreie, was Kiyama zwingt, ihre Schüler in die Obhut von MAR zu übergeben.

Kazari Uiharu, motiviert durch ihre Sorge um Haruue Erii, besucht Dr. Kiyama, um sie zur Zusammenarbeit mit MAR zu überreden, was sie zur MAR-Einrichtung führt, um sich mit Therestina Kihara Lifeline zu treffen. Therestina nimmt Kiyamas Forschungsmaterialien an, zerstört sie aber sofort und verweigert jeden Kontakt mit den komatösen Child Errors, einschließlich Erii. Als ein Arzt Therestina als "Dr. Kihara" anspricht, offenbart sie ihre volle Identität als Enkelin von Gensei Kihara und das ursprüngliche Testsubjekt für sein Ability Crystal-Programm, was ihre bösartigen Absichten bestätigt. Uiharu kehrt geschockt ins Judgment-Büro zurück, doch Kuroko Shirais energisches Eingreifen hilft ihr, sich wieder auf die anstehende Aufgabe zu konzentrieren. Basierend auf diesen neuen Informationen konfrontiert Mikoto Misaka Therestina in der MAR-Basis, wird jedoch durch die Capacity Down-Vorrichtung außer Gefecht gesetzt und von Therestinas Kraftanzug überwältigt. Nachdem Mitsuko Kongou die bewusstlose Mikoto heimlich rettet, versucht die wiederhergestellte Railgun, den Kampf alleine fortzusetzen, und macht sich selbst für die Situation verantwortlich. Ruiko Saten blockiert Mikotos Weg körperlich und bittet sie, zu überlegen, was sie um sich herum sieht, und erinnert sie daran, dass ihre Freunde anwesend und bereit zu helfen sind. Die Gruppe findet wieder zusammen, überwindet ihre Differenzen und nutzt das Satellitensystem von Judgment, um Therestinas Konvoi in Richtung Distrikt 17 zu verfolgen, wobei sie auch Dr. Kiyamas Auto auf derselben Route entdeckt. Sie sichern sich widerwillige Unterstützung von der Anti-Skill-Beamtin Aiho Yomikawa, und während sie sich zum Aufbruch bereitmachen, macht Uiharu eine entscheidende Beobachtung in der Satellitenübertragung, die ihr Eingreifen lenken wird.

Die Folge beginnt mit einer Rückblende, die zeigt, dass Therestina Kihara einen Kristall mit der Aufschrift 'Probe 01' besitzt, der vor Jahren von ihrem Großvater Gensei Kihara aus ihr erschaffen wurde. In der Gegenwart fangen Mikoto und ihre Freunde einen Köderkonvoi von Multi-Active Rescue-Fahrzeugen ab und erfahren von Uiharu, dass die komatösen Kinder anderswohin transportiert werden. Kuroko und Kongou bleiben zurück, um die angetriebenen Anzüge zu bekämpfen, während Kiyama Uiharu und Saten zum tatsächlichen Aufenthaltsort der Kinder fährt, verfolgt von Mikoto und Konori. Therestina, die einen großen Mecha steuert, greift die Gruppe auf der Autobahn an und zwingt Mikoto, das Auto vom Dach aus zu verteidigen. Mit Kurokos Teleportationshilfe nutzt Mikoto eine abgetrennte Mecha-Hand als Railgun-Projektil, um Therestinas Maschine außer Gefecht zu setzen. Die Gruppe findet die Einrichtung und entdeckt Kiyamas Schüler, darunter Haruue, in versiegelten Röhren. Therestina aktiviert die 'Capacity Down'-Vorrichtung, die die Esper im Raum lähmt, aber Saten, die aufgrund ihres Level-0-Status nicht betroffen ist, zerstört das Kontrollsystem, nachdem Uiharu sie heimlich dorthin geleitet hat. Von der Lähmung befreit, nutzt Mikoto ihre Kräfte, um Therestina zu überwältigen, die dann droht, die Einrichtung mit der eingebauten Railgun ihres Anzugs zu zerstören. Mikoto kontert den Angriff mit ihrer eigenen Railgun, besiegt Therestina und erhält den ursprünglichen Fähigkeitskristall. Mit dem Kristall schließt Kiyama ihr Behandlungsprogramm erfolgreich ab und weckt ihre Schüler. Die Folge endet Tage später, als die genesenden Kinder über ein Stadtluftschiff eine Geburtstagsnachricht an Kiyama senden und ihre Dankbarkeit ausdrücken.