Frisch von der Universität, ist Kumiko Yamaguchis lebenslanger Traum, Lehrerin an einer Oberschule zu werden. Sie wird an der Shirokin Gakuen, einer privaten Jungenschule, eingestellt, aber sofort als Klassenlehrerin für die Klasse 3-D zugeteilt, dem berüchtigten Auffangbecken für die hoffnungslosesten Problemfälle der Schule. Die Schüler, angeführt vom coolen und aufmerksamen Shin Sawada, versuchen zunächst, sie durch Einschüchterung und Streiche zum Aufgeben zu zwingen. Doch ihr Plan scheitert an Kumikos bizarren Durchhaltevermögen, unerschütterlichem Optimismus und überraschender körperlicher Aggressivität.

Was niemand an der Schule weiß, ist, dass Kumiko, von ihren Schülern Yankumi genannt, die Erbin der Oedo-Gruppe ist, eines der mächtigsten Yakuza-Clans Tokios. Nach dem Tod ihrer Eltern von ihrem Großvater, dem Clan-Chef, aufgezogen, verfügt sie über unglaubliche Kampfkunstfähigkeiten und ein tiefes Verständnis für den Ehrenkodex der Straße, den sie unbeabsichtigt auf ihre Lehrmethoden anwendet. Sie trägt einen Trainingsanzug, spricht in Yakuza-Slang und hat die Angewohnheit, vor Polizisten wegzulaufen, aber ihre geheime Identität muss um jeden Preis geschützt werden. Wenn der Schulvorstand ihren Hintergrund entdeckt, ist ihre Lehrerkarriere beendet.

Während der ersten Staffel setzt Yankumi ihre unkonventionellen, in der Yakuza geschärften Taktiken ein, um ihre Schüler vor realen Bedrohungen zu schützen, darunter rivalisierende Gangs, Kredithai und korrupte Autoritätspersonen. Trotz ihres Geheimnisses lernen ihre Kernschüler – darunter der loyale Shin, der hitzköpfige Youichi Minami, der sanfte Riese Teruo Kumai, der blondhaarige Haruhiko Uchiyama und der verspielte Takeshi Noda – allmählich ihren unerschütterlichen Einsatz zu respektieren. Sie geben ihr den liebevollen Spitznamen Yankumi, eine Mischung aus Yankee (Delinquent) und Sensei. Während der stellvertretende Schulleiter Goro Sawatari ständig intrigiert, um sie feuern zu lassen, kämpft Yankumi darum, ihre Klasse vor dem Schulabbruch zu bewahren, und lehrt sie, dass Loyalität und Ehre wichtiger sind als akademische Noten.

Die Realserie umfasst drei Staffeln und einen abschließenden Kinofilm und folgt jedes Jahr einem ähnlichen Erzählmuster. In jeder Staffel wechselt Kumiko nach einem Vorfall, bei dem ihr Geheimnis fast aufgedeckt wird, an eine neue Jungenschule (Kurogin Gakuen in Staffel zwei, Akadou Gakuen in Staffel drei). An jeder neuen Schule wird sie unweigerlich der gewalttätigsten und gleichgültigsten Klasse von Drittklässlern zugeteilt. Obwohl die Nebenbesetzung der Schüler jede Staffel wechselt, um neue Jungschauspieler zu präsentieren, bleibt die Kern-Dynamik dieselbe: Yankumi muss das Vertrauen einer neuen Gruppe von Delinquenten gewinnen, während sie ihre Yakuza-Herkunft vor der Schulleitung verbirgt und deren persönliche Krisen mit ihren Fäusten und ihrem Herzen löst.

Bemerkenswerte Handlungsbögen umfassen, dass die Schüler ihre wahre Identität entdecken, sich aber entscheiden, sie geheim zu halten, Yankumi einen Drogenring zerschlägt, der ihre Schüler ins Visier nimmt, und das wiederkehrende Thema der Abschlussfeier, bei der ihre schwierigsten Schüler sie schließlich als die beste Lehrerin anerkennen, die sie je hatten. Ein TV-Special, Gokusen Special: Sayonara 3-nen D-gumi, diente als Epilog zur ersten Staffel, und die Handlung schließt mit dem Film Gokusen: The Movie von 2009 ab, der Darsteller aus allen drei Staffeln zu einer finalen Konfrontation zusammenbringt. Während der gesamten Serie ringt Kumiko damit, ihre beiden Identitäten in Einklang zu bringen: die sanfte, idealistische Lehrerin und die mächtige, erbberechtigte Kämpferin des Syndikats, und beweist, dass man ein Boss sein kann, indem man sich um Menschen kümmert, anstatt sie zu beherrschen.