"Beet the Vandel Buster" spielt in einer Welt, die von den finsteren Kreaturen namens Vandels beherrscht wird. Diese Wesen terrorisieren die Menschheit und haben das Land in Chaos und Zerstörung gestürzt. Um gegen diese Bedrohung vorzugehen, gibt es die sogenannten Bustergruppen, mutige Kämpfer, die sich der Aufgabe widmen, die Vandels zu besiegen und die Welt zu retten. Die Serie konzentriert sich auf den jungen Beet, der davon träumt, ein legendärer Buster zu werden. Sein Vorbild ist der berühmte Held Zenon, der als stärkster Buster gilt und die Menschheit vor den Vandels beschützt.

Beet schließt sich einer Gruppe von Bustern an, darunter Poala, eine erfahrene Kämpferin, und Grifton, ein mysteriöser und starker Krieger. Zusammen reisen sie durch die Welt, um Vandels zu bekämpfen und die Bedrohung für die Menschheit zu verringern. Im Laufe der Serie entwickelt Beet seine Fähigkeiten weiter und lernt, mit seinen Gefährten zusammenzuarbeiten, um immer mächtigere Gegner zu besiegen. Dabei stößt er auf zahlreiche Herausforderungen, darunter die Konfrontation mit den mächtigen Vandel-Königen, die über immense Kräfte verfügen und die Welt weiterhin in Angst und Schrecken versetzen.

Ein zentrales Element der Handlung ist die sogenannte "Vandel-Buster-Legende", die besagt, dass nur ein auserwählter Buster die ultimative Macht erlangen kann, um die Vandels endgültig zu besiegen. Beet strebt danach, dieser legendäre Held zu werden, und muss dabei nicht nur seine körperlichen Grenzen überwinden, sondern auch moralische Dilemmata und persönliche Konflikte bewältigen. Die Serie verbindet Action, Abenteuer und Charakterentwicklung, während sie die Kämpfe gegen die Vandels und die Beziehungen zwischen den Bustern in den Vordergrund stellt.