"Squid Girl Season 2" setzt die humorvolle und leichtherzige Geschichte der Tintenfischmädchen Squid Girl fort, die sich ursprünglich aufmachte, die Menschheit für die Verschmutzung der Ozeane zu bestrafen. Nachdem sie im ersten Teil jedoch scheiterte und stattdessen in einem Strandrestaurant namens "Aizen" arbeitete, entwickelt sich ihre Beziehung zur menschlichen Welt weiter. In der zweiten Staffel bleibt Squid Girl weiterhin in der Obhut der Schwestern Eiko und Chizuru Aizawa, die das Restaurant betreiben. Die Serie behält ihren episodischen Charakter bei, wobei jede Folge in sich abgeschlossene Geschichten präsentiert, die oft auf Slapstick und absurdem Humor basieren.

Squid Girl versucht weiterhin, ihre Pläne zur Eroberung der Menschheit zu verfolgen, scheitert jedoch regelmäßig an ihrer Naivität und den alltäglichen Herausforderungen des menschlichen Lebens. Ihre Versuche, sich als Bedrohung zu präsentieren, werden oft durch ihre kindliche Neugier und ihre zunehmende Integration in die menschliche Gesellschaft untergraben. Neben den Aizawa-Schwestern spielen auch andere Nebencharaktere eine wichtige Rolle, darunter der junge Takeru, der Squid Girl oft als Spielkameradin sieht, und der exzentrische Wissenschaftler Gorou, der sich für ihre Tintenfischfähigkeiten interessiert.

Die Handlung bleibt weitgehend leicht und unterhaltsam, mit gelegentlichen Momenten, die die Freundschaft und das Zusammenleben zwischen Squid Girl und den Menschen betonen. Die Serie nutzt weiterhin humorvolle Situationen, die aus den kulturellen Unterschieden zwischen Squid Girl und den Menschen entstehen, sowie ihre ungewöhnlichen Fähigkeiten, wie das Versprühen von Tinte oder das Benutzen ihrer Tentakel. Insgesamt bietet die zweite Staffel eine Fortsetzung der charmanten und humorvollen Dynamik, die bereits in der ersten Staffel etabliert wurde, ohne größere narrative Veränderungen einzuführen.