Klasse 3-D hat endlich ihr drittes Jahr erreicht, doch ihre unkonventionelle Lehrerin Kumiko Yamaguchi, die ihren Schülern als Yankumi bekannt ist, steht vor ihrer größten Herausforderung: dem Abschied. Die Spezialfolge Gokusen Special: Sayonara 3-nen D-gumi dient sowohl als Fortsetzung der ersten Staffel der Live-Action-Serie als auch als Prequel zur zweiten. Die Geschichte begleitet Yankumi in den letzten Tagen mit ihrer geliebten Heimklasse an der Shirokin Gakuin, der privaten Jungenschule, an der sie ihre Lehrerkarriere begann. Während der ersten Staffel erwarb Yankumi, die heimlich die Erbin des Oedo-Yakuza-Clans ist, den Respekt ihrer schwierigen Schüler nicht durch Lehrbücher, sondern durch ihren unerschütterlichen Glauben an sie und ihre beeindruckenden Kampffähigkeiten, die sie einsetzt, um sie vor echten Bedrohungen zu schützen. Das Special bringt ihre Reise mit den ursprünglichen Schülern der 3-D zum Abschluss, darunter Shin Sawada, der Klassensprecher, der ihr Geheimnis entdeckte; seine engen Freunde Youichi Minami, Haruhiko Uchiyama, Teruo Kumai und Takeshi Noda; sowie ihre Kollegin Shizuka Fujiyama. Die Erzählung konzentriert sich auf Abschiede, da der Abschluss naht, wobei Yankumi darüber nachdenkt, wie sehr sie und ihre Schüler gewachsen sind, seit sie als naive Lehrerin ankam. Der Titel Sayonara 3-nen D-gumi (Auf Wiedersehen, Klasse 3-D) unterstreicht diesen emotionalen Abschluss. Nach dem Abschluss der Schüler bereitet das Special den Übergang zur zweiten Staffel vor, indem es zeigt, dass die Shirokin Gakuin schließt, was Yankumi zwingt, eine neue Lehrstelle an einer anderen Schule zu finden. Die Folge schließt somit den Bogen der ursprünglichen Klasse, während sie den Weg für Yankumi ebnet, mit einer neuen Gruppe schwieriger Schüler neu anzufangen, getragen von denselben Prinzipien der Loyalität, Gerechtigkeit und strengen Liebe, die ihre Zeit mit der 3-D prägten.