"Mobile Suit Gundam: Iron-Blooded Orphans" spielt in einer post-apokalyptischen Zukunft, in der die Menschheit nach einem verheerenden Krieg, bekannt als der Calamity War, in einer neuen Gesellschaftsordnung lebt. Die Geschichte konzentriert sich auf die Organisation Tekkadan, eine Gruppe von ehemaligen Kindersoldaten und Arbeitern, die sich aus den unterdrückten Schichten der Gesellschaft rekrutieren. Die Handlung beginnt auf dem Planeten Mars, wo die Arbeiter der Firma Chryse Guard Security (CGS) unter harten Bedingungen leben und arbeiten. Als die Firma von einer mächtigen Gruppe namens Gjallarhorn angegriffen wird, übernehmen die Kinder und Jugendlichen der dritten Abteilung von CGS die Kontrolle und gründen Tekkadan, um ihr Schicksal selbst in die Hand zu nehmen.

Der Protagonist Mikazuki Augus, ein stiller und entschlossener junger Mann, pilotiert den mächtigen Mobile Suit Gundam Barbatos, einen Relikt aus dem Calamity War. Zusammen mit seinem Freund und Anführer Orga Itsuka strebt Tekkadan danach, Anerkennung und Unabhängigkeit in einer Welt zu erlangen, die von politischen Intrigen und wirtschaftlicher Ausbeutung geprägt ist. Die Gruppe nimmt gefährliche Aufträge an, um ihre Position zu stärken, und gerät dabei in Konflikte mit mächtigen Organisationen wie Gjallarhorn, die die bestehende Ordnung aufrechterhalten wollen.

Im Laufe der Serie entwickelt sich Tekkadan von einer kleinen Gruppe von Rebellen zu einer einflussreichen Kraft, die in die politischen Machtkämpfe zwischen den verschiedenen Fraktionen der Erde und des Mars verwickelt wird. Die Beziehungen zwischen den Charakteren, insbesondere die Loyalität und Kameradschaft innerhalb von Tekkadan, spielen eine zentrale Rolle. Gleichzeitig werden die moralischen Dilemmata und die menschlichen Kosten des Krieges thematisiert, da die Mitglieder von Tekkadan oft gezwungen sind, schwierige Entscheidungen zu treffen, um ihr Überleben zu sichern.

Die Serie besteht aus zwei Staffeln, die die Entwicklung von Tekkadan und ihren Kampf um Freiheit und Anerkennung detailliert darstellen. Dabei werden sowohl die politischen und sozialen Aspekte der Welt als auch die persönlichen Geschichten der Charaktere beleuchtet. "Mobile Suit Gundam: Iron-Blooded Orphans" zeichnet sich durch eine düstere und realistische Darstellung von Krieg und Konflikt aus, wobei die Charaktere oft mit den Konsequenzen ihrer Handlungen konfrontiert werden.