"Midnight Strike Force" (OVA) handelt von einer Gruppe von Spezialagenten, die in einer dystopischen Zukunft gegen korrupte Regierungsstrukturen und kriminelle Organisationen kämpfen. Die Handlung spielt in einer Metropole, die von politischer Korruption und technologischer Überwachung geprägt ist. Die Protagonisten, angeführt von dem charismatischen und strategisch denkenden Kommandanten Kaito, setzen sich aus ehemaligen Militärs, Hackern und Undercover-Agenten zusammen. Jedes Mitglied bringt spezifische Fähigkeiten in die Gruppe ein, die für die Durchführung ihrer Missionen entscheidend sind.

Die Geschichte beginnt mit der Aufdeckung eines geheimen Regierungsprojekts, das darauf abzielt, die Bevölkerung durch fortschrittliche Technologie zu kontrollieren. Die Gruppe, bekannt als "Midnight Strike Force," erhält Informationen über dieses Projekt und beschließt, es zu sabotieren. Dabei stoßen sie auf zahlreiche Hindernisse, darunter hochgerüstete Gegner, verräterische Informanten und interne Konflikte innerhalb des Teams. Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von taktischen Missionen, bei denen die Gruppe sowohl physische als auch digitale Barrieren überwinden muss.

Ein zentraler Konflikt dreht sich um die Figur der Hackerin Yumi, die eine persönliche Verbindung zu einem der Hauptantagonisten hat. Ihre Loyalität wird im Laufe der Geschichte auf die Probe gestellt, was zu Spannungen innerhalb des Teams führt. Parallel dazu wird die Beziehung zwischen Kaito und seiner ehemaligen Partnerin, der Undercover-Agentin Rina, thematisiert, die im Rahmen der Missionen wieder aufeinandertreffen. Die Handlung wird durch politische Intrigen, moralische Dilemmata und die Frage nach dem Preis der Freiheit vorangetrieben.

Die OVA besteht aus mehreren Episoden, die jeweils einen spezifischen Aspekt der Mission beleuchten, während sie gleichzeitig die Hintergründe der Charaktere und ihre Motivationen vertiefen. Die Erzählung bleibt eng auf die Aktionen der Gruppe fokussiert, wobei die technologischen und gesellschaftlichen Aspekte der dystopischen Welt als Hintergrund dienen. Die Handlung gipfelt in einem finalen Konflikt, bei dem die Gruppe ihre Fähigkeiten und ihren Zusammenhalt unter Beweis stellen muss, um das Regime zu stürzen und die Freiheit der Bevölkerung zu sichern.