"Brynhildr in the Darkness" ist eine Anime-Serie, die auf dem gleichnamigen Manga von Lynn Okamoto basiert. Die Handlung dreht sich um Ryōta Murakami, einen hochbegabten Schüler, der sich seit dem Tod seiner Kindheitsfreundin Kuroneko mit Astronomie beschäftigt, um ihre Existenz zu beweisen. Jahre später trifft er auf eine mysteriöse Transferstudentin namens Kuroha Neko, die Kuroneko verblüffend ähnlich sieht. Obwohl sie ihre Identität zunächst leugnet, enthüllt sich nach und nach, dass Kuroha Teil einer Gruppe von Mädchen ist, die mit übernatürlichen Fähigkeiten ausgestattet sind. Diese Fähigkeiten, die als "Hexen" bezeichnet werden, wurden ihnen durch Experimente einer geheimen Organisation verliehen.

Die Serie erkundet die Beziehung zwischen Ryōta und Kuroha sowie die anderen Hexen, die sich in ihrer Umgebung befinden. Jedes der Mädchen besitzt einzigartige Kräfte, die jedoch mit schwerwiegenden Nebenwirkungen verbunden sind, wie einer begrenzten Lebenserwartung oder körperlichen Beeinträchtigungen. Die Organisation, die für ihre Schöpfung verantwortlich ist, verfolgt die Mädchen unerbittlich, um sie zu eliminieren oder zurückzugewinnen. Ryōta wird in diesen Konflikt hineingezogen und versucht, die Mädchen zu beschützen, während er gleichzeitig die Wahrheit über Kuronekos Schicksal und die Experimente aufdeckt.

Im Verlauf der Serie werden die Hintergründe der Organisation, die Motivationen der Antagonisten und die tragischen Schicksale der Hexen näher beleuchtet. Die Handlung ist geprägt von düsteren Themen wie Verlust, Schuld und den ethischen Implikationen wissenschaftlicher Experimente. Die Charaktere entwickeln sich durch ihre gemeinsamen Kämpfe und die Konfrontation mit ihrer Vergangenheit weiter, was zu emotionalen und oft tragischen Momenten führt. Die Serie kombiniert Elemente von Science-Fiction, Mystery und Drama, während sie die Beziehungen zwischen den Charakteren und ihre individuellen Kämpfe in den Vordergrund stellt.