Auf der Suche nach Rache für den Mord an seinem engen Freund und Mentor Goro Numata infiltriert der eigensinnige und exzentrische Shigeru Jo vorsätzlich die böse Organisation Black Satan. Er meldet sich freiwillig für ihr Cyborg-Verstärkungsprogramm und heuchelt Loyalität, um die nötige Kraft zu erlangen. Nach einer Operation, die ihn in einen elektrisch betriebenen Supersoldaten verwandelt, enthüllt Shigeru seine wahren Absichten, entkommt, bevor er einer Gehirnwäsche unterzogen werden kann, und erklärt sich selbst zu Kamen Rider Stronger.

Während seiner Flucht trifft Shigeru auf Yuriko Misaki, einen weiteren jungen Cyborg von Black Satan, der sich in den Elektrowellen-Menschen Tackle verwandeln kann. Er rettet sie, überzeugt Yuriko, sich seiner Sache anzuschließen, und gemeinsam kämpfen sie gegen den Feldzug der Organisation zur Weltherrschaft. Bald gesellt sich Tobei Tachibana zu ihnen, ein erfahrener Verbündeter früherer Kamen Riders, der als Mentor für das Duo fungiert.

Die frühe Handlung stellt Stronger und Tackle gegen die hochrangigen Kommandanten von Black Satan, den charmanten und skrupellosen Mr. Titan und den ritterlichen General Shadow. Diese beiden Kommandanten sind erbitterte Rivalen, und ihr ständiges Gezänk darüber, wer Stronger vernichten wird, bietet den Helden oft eine Chance zur Flucht. Nachdem Mr. Titan besiegt und später als der mächtigere Hundertäugige Titan wiederbelebt wird, gelingt es Stronger schließlich, Black Satan endgültig zu stürzen.

Nach der Zerstörung von Black Satan bildet General Shadow ein neues und gefährlicheres Terroristennetzwerk, die Delza-Armee. Der Kampf gegen diesen neuen Feind nimmt eine verheerende Wendung, als Yuriko, vergiftet in einem Kampf mit dem Delza-General Doctor Kate, ihr eigenes Leben opfert, indem sie einen finalen, selbstmörderischen Angriff einsetzt, um Shigeru zu retten. Ihr Tod beeinflusst Stronger zutiefst und treibt ihn dazu, eine gefährliche Zweitoperation durchzuführen, die ihm eine temporäre, aber ungeheuer mächtige Aufrüstung namens Charge-Up-Form verleiht. Diese neue Kraft ist ein zweischneidiges Schwert, da er seinen Feind innerhalb einer Minute besiegen muss, sonst riskiert er, durch die überschüssige Energie zu explodieren.

Im letzten Handlungsbogen kehren die sechs vorherigen Kamen Riders – Rider 1, Rider 2, V3, Riderman, X und Amazon – nach Japan zurück, um Stronger zu helfen. Gemeinsam vereinen sich die sieben legendären Krieger zu einer letzten Schlacht gegen die Delza-Armee, besiegen General Shadow und ihren wahren Anführer, den Großen Leader, der der ursprüngliche Drahtzieher hinter Shocker ist. Die Serie endet damit, dass Shigeru, nachdem er seinen Freund gerächt und Tackles Opfer geehrt hat, seinen Kampf für die Gerechtigkeit fortsetzt.