"Penguindrum" ist eine Anime-Serie, die die Geschichte der Brüder Kanba und Shōma Takakura sowie ihrer jüngeren Schwester Himari erzählt. Die Handlung beginnt damit, dass Himari aufgrund einer schweren Krankheit stirbt. Doch durch die mysteriöse Intervention eines magischen Gegenstands, des sogenannten "Penguin Drum", wird sie wieder zum Leben erweckt. Dieser Gegenstand ist mit einem Pinguinkostüm verbunden, das Himari nun tragen muss, um am Leben zu bleiben. Allerdings hat diese Rettung einen Preis: Die Brüder müssen eine mysteriöse Entität namens "Survival Strategy" finden, die ihnen in Form eines Pinguins erscheint und ihnen rätselhafte Anweisungen gibt.

Die Suche nach der "Survival Strategy" führt die Brüder in eine komplexe und oft surreal anmutende Welt, in der sie auf verschiedene Charaktere treffen, darunter Ringo Oginome, eine obsessive junge Frau, die in ihre eigene mysteriöse Mission verstrickt ist. Ringo versucht, das Leben ihrer verstorbenen Schwester zu rekonstruieren, indem sie sich in deren Tagebüchern verliert und versucht, deren Schicksal nachzuahmen. Ihre Wege kreuzen sich mit denen der Takakura-Brüder, und ihre Geschichten verflechten sich zunehmend.

Im Laufe der Serie werden die Hintergründe der Charaktere und ihre Verbindungen zueinander enthüllt. Es wird deutlich, dass die Handlung tief in Themen wie Schicksal, Erinnerung, familiäre Bindungen und gesellschaftliche Strukturen verwurzelt ist. Die Serie nutzt symbolische Elemente und wiederkehrende Motive, um eine komplexe Erzählung zu weben, die sowohl persönliche als auch politische Dimensionen aufweist. Die "Survival Strategy" erweist sich als zentraler Schlüssel, der nicht nur das Schicksal der Takakura-Geschwister, sondern auch das anderer Charaktere beeinflusst.

Die Charaktere sind vielschichtig und entwickeln sich im Laufe der Serie weiter. Kanba, der ältere Bruder, ist bereit, alles zu tun, um seine Schwester zu retten, auch wenn dies bedeutet, moralische Grenzen zu überschreiten. Shōma, der jüngere Bruder, ist oft unsicher und versucht, einen Weg zu finden, der sowohl Himari rettet als auch seine eigenen moralischen Prinzipien bewahrt. Ringo, die zunächst als obsessive und manipulativ dargestellt wird, zeigt im Laufe der Serie tiefere Schichten ihrer Persönlichkeit und ihrer Motivationen.

Die Handlung von "Penguindrum" ist durchzogen von Rückblenden und Vorahnungen, die die Zusammenhänge zwischen den Charakteren und ihren Schicksalen allmählich enthüllen. Die Serie endet mit einer Auflösung, die sowohl befriedigend als auch offen für Interpretationen ist, wobei viele der symbolischen Elemente und Handlungsstränge in einer Weise zusammengeführt werden, die zum Nachdenken anregt.