"Gakuen Alice" ist eine Anime-Serie, die auf dem gleichnamigen Manga von Tachibana Higuchi basiert. Die Handlung dreht sich um Mikan Sakura, ein lebhaftes und emotionales Mädchen aus dem ländlichen Japan, das nach dem Umzug ihrer besten Freundin Hotaru Imai nach Tokio beschließt, ihr zu folgen. Hotaru besucht die Alice-Akademie, eine exklusive Schule für Kinder mit besonderen Fähigkeiten, die als "Alices" bezeichnet werden. Mikan, die zunächst keine Ahnung von diesen Fähigkeiten hat, schafft es, in die Akademie aufgenommen zu werden, nachdem sie ihre eigene Alice entdeckt: die Fähigkeit, die Kräfte anderer Alices zu nullifizieren.

Die Alice-Akademie ist ein Ort voller Geheimnisse und strenger Hierarchien, an dem die Schüler in verschiedene Klassen eingeteilt werden, basierend auf der Stärke und Nützlichkeit ihrer Fähigkeiten. Mikan, die in die niedrigste Klasse eingestuft wird, muss sich gegen Vorurteile und Herausforderungen behaupten, während sie versucht, ihre Freundschaft mit Hotaru aufrechtzuerhalten. Hotaru, die eine technische Alice besitzt und oft distanziert wirkt, zeigt dennoch eine tiefe Zuneigung zu Mikan und unterstützt sie, wo sie kann.

Im Laufe der Serie wird die Beziehung zwischen Mikan und Natsume Hyūga, einem mysteriösen und oft abweisenden Schüler mit einer gefährlichen Alice, zentral. Natsume, der die Fähigkeit besitzt, Feuer zu kontrollieren, hat eine dunkle Vergangenheit und steht unter der strengen Aufsicht der Akademie. Trotz seiner rauen Art entwickelt sich langsam eine Verbindung zwischen ihm und Mikan, die seine emotionalen Barrieren durchbricht. Auch Ruka Nogi, ein weiterer Schüler mit der Alice, Tiere anzulocken, spielt eine wichtige Rolle. Ruka ist freundlich und einfühlsam, was ihn zu einem Kontrast zu Natsume macht, und er entwickelt ebenfalls Gefühle für Mikan.

Die Serie erforscht nicht nur die persönlichen Beziehungen der Charaktere, sondern enthüllt auch die dunklen Geheimnisse der Alice-Akademie. Es wird deutlich, dass die Schule nicht nur ein Ort der Bildung ist, sondern auch ein Ort, an dem Schüler mit mächtigen Alices für undurchsichtige Zwecke manipuliert werden. Mikan wird in diese Intrigen hineingezogen und muss sich gegen die korrupten Machenschaften der Akademie stellen, während sie gleichzeitig versucht, ihre Freunde zu schützen.

"Gakuen Alice" kombiniert Elemente von Comedy, Drama und Fantasy, wobei die emotionalen Momente und die Charakterentwicklung im Vordergrund stehen. Die Serie behandelt Themen wie Freundschaft, Loyalität und die Bedeutung, sich selbst zu akzeptieren, während sie die Herausforderungen und Konflikte in einer Welt voller übernatürlicher Fähigkeiten darstellt.