"Freedom" ist eine OVA-Serie, die in einer postapokalyptischen Zukunft spielt, in der die Menschheit in einer unterirdischen Stadt namens "Eden" lebt. Die Stadt wird von einer strengen Hierarchie und Kontrolle dominiert, die den Bewohnern ein scheinbar perfektes, aber stark eingeschränktes Leben bietet. Die Handlung konzentriert sich auf Takeru, einen jungen Mann, der von der Welt außerhalb von Eden fasziniert ist. Zusammen mit seinen Freunden Kazuma und Bismarck bricht er aus der Stadt aus, um die Wahrheit über die verbotene Oberfläche zu erfahren.

Auf ihrer Reise entdecken sie, dass die Oberfläche nicht unbewohnbar ist, wie ihnen beigebracht wurde, sondern eine lebendige, wenn auch gefährliche Welt darstellt. Sie treffen auf Überreste der alten Zivilisation, darunter ein verlassenes Mondbasisprojekt namens "Freedom", das einst als Zufluchtsort für die Menschheit gedacht war. Die Gruppe stößt auch auf eine mysteriöse Frau namens Aoi, die ihnen hilft, die Geheimnisse der Vergangenheit zu entschlüsseln.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass die Führung von Eden die Bewohner absichtlich in Unwissenheit hält, um die Kontrolle über sie zu behalten. Takeru und seine Freunde beschließen, gegen diese Unterdrückung zu kämpfen und die Wahrheit ans Licht zu bringen. Ihre Reise ist geprägt von Gefahren, Entdeckungen und der Konfrontation mit den Mächten, die Eden kontrollieren. Die Serie verbindet Elemente von Science-Fiction, Abenteuer und sozialer Kritik, während sie die Themen Freiheit, Rebellion und die Suche nach der Wahrheit erforscht.