"B: The Beginning" ist eine Anime-OVA, die in der fiktiven Stadt Cremona spielt, einem Ort, der von Verbrechen und mysteriösen Ereignissen heimgesucht wird. Die Handlung verbindet Elemente eines Kriminalthrillers mit übernatürlichen und wissenschaftlichen Themen. Im Zentrum der Geschichte steht Keith Kazama Flick, ein genialer Ermittler der königlichen Polizei, der für seine unkonventionellen Methoden bekannt ist. Keith wird in die Ermittlungen um eine Serie von Morden verwickelt, die von einem mysteriösen Serienkiller namens "Killer B" begangen werden. Die Opfer sind oft mit rätselhaften Symbolen markiert, die auf eine größere Verschwörung hindeuten.

Parallel dazu wird die Geschichte von Koku, einem jungen Mann mit übernatürlichen Fähigkeiten, erzählt. Koku ist auf der Suche nach einer Frau namens Yuna, die ihm sehr wichtig ist. Seine Fähigkeiten, darunter übermenschliche Geschwindigkeit und Stärke, machen ihn zu einer zentralen Figur in den Ereignissen, die sich in Cremona abspielen. Im Laufe der Handlung wird deutlich, dass Kokus Vergangenheit eng mit den Experimenten eines geheimen Forschungsprojekts namens "Market Maker" verbunden ist. Dieses Projekt hat zum Ziel, menschliche Fähigkeiten durch genetische Manipulation zu erweitern, und steht im Mittelpunkt der Verschwörung, die Keith und Koku aufdecken.

Die Handlung verwebt die beiden Erzählstränge von Keiths Ermittlungen und Kokus Suche, während sich die Charaktere allmählich näherkommen. Dabei werden Geheimnisse über die wahre Natur des "Killer B" und die Machenschaften von "Market Maker" enthüllt. Die Serie thematisiert Fragen nach Identität, Moral und den Konsequenzen wissenschaftlicher Experimente am Menschen. Die Charaktere sind komplex und vielschichtig, wobei Keiths analytischer Verstand und Kokus emotionale Motivation im Mittelpunkt stehen. Die Handlung entwickelt sich zu einem spannenden Finale, in dem die Schicksale der Charaktere und die Zukunft von Cremona auf dem Spiel stehen.