In der Anime-Serie "Sekirei" spielt die Handlung in einer fiktiven Version von Tokio, die als Shinto Teito bekannt ist. Die Stadt ist Schauplatz eines mysteriösen Wettbewerbs, der als "Sekirei-Plan" bezeichnet wird. Dieser Plan involviert 108 übernatürliche Wesen, die Sekirei genannt werden. Diese Wesen, meist weiblich, besitzen besondere Kräfte und sind dazu bestimmt, sich mit ausgewählten Menschen, den sogenannten Ashikabi, zu verbinden. Diese Verbindung, die als "Wingding" bezeichnet wird, ermöglicht es den Sekirei, ihre volle Kraft zu entfalten und im Wettbewerb zu kämpfen.

Der Protagonist der Serie ist Minato Sahashi, ein junger Mann, der in seinem Leben bisher wenig Erfolg hatte. Nachdem er bei einer Aufnahmeprüfung für die Universität durchgefallen ist, trifft er auf Musubi, eine Sekirei, die vor ihren Verfolgern flieht. Durch einen Zufall wird Minato zu Musubis Ashikabi, wodurch er ungewollt in den Sekirei-Plan hineingezogen wird. Im Laufe der Serie trifft Minato auf weitere Sekirei, darunter Tsukiumi, Kusano und Matsu, die sich ebenfalls mit ihm verbinden. Jede dieser Sekirei hat einzigartige Fähigkeiten und Persönlichkeiten, die die Dynamik der Gruppe prägen.

Der Sekirei-Plan wird von der MBI Corporation kontrolliert, einem mächtigen Unternehmen, das die Sekirei erschaffen hat und den Wettbewerb überwacht. Ziel des Plans ist es, die stärkste Sekirei und ihren Ashikabi zu ermitteln. Die Kämpfe zwischen den Sekirei sind oft intensiv und gewalttätig, wobei die Verlierer aus dem Wettbewerb ausscheiden. Neben den Kämpfen gibt es auch politische Intrigen und Machtkämpfe innerhalb der MBI, die den Verlauf des Plans beeinflussen.

Die Beziehungen zwischen den Sekirei und ihren Ashikabi sind ein zentrales Thema der Serie. Die Verbindung zwischen ihnen ist nicht nur von strategischer Bedeutung, sondern auch emotional aufgeladen. Viele Sekirei entwickeln starke Gefühle für ihre Ashikabi, was zu romantischen und dramatischen Konflikten führt. Minato, der anfangs unwissend und unerfahren ist, wächst im Laufe der Serie in seine Rolle als Ashikabi hinein und entwickelt enge Bindungen zu seinen Sekirei.

Die Serie kombiniert Action, Comedy und romantische Elemente, wobei die Kämpfe und die Entwicklung der Charaktere im Vordergrund stehen. Die Handlung wird durch humorvolle Szenen und Fanservice aufgelockert, bleibt aber auch ernsthaft, wenn es um die Hintergründe des Sekirei-Plans und die Schicksale der Charaktere geht. Die Serie endet mit offenen Fragen und Andeutungen auf mögliche Fortsetzungen, die die Zuschauer in Spannung halten.