"Chaos Dragon" spielt in einer fiktiven Welt, die von politischen Konflikten und mystischen Kräften geprägt ist. Die Handlung dreht sich um das Königreich Dálnai, das nach einem verheerenden Krieg zwischen zwei mächtigen Drachen, dem Roten und dem Schwarzen Drachen, in Chaos versinkt. Der Rote Drache, einst Beschützer des Königreichs, wurde während des Krieges getötet, und sein Geist wurde in den Körper des jungen Prinzen Ibuki transferiert. Ibuki, der Protagonist der Serie, trägt nun die Verantwortung, den Roten Drachen zu kontrollieren, während er gleichzeitig mit den inneren Konflikten und der Last dieser Verbindung kämpft.

Die Geschichte beginnt, als das Königreich Dálnai von der benachbarten Nation Kouran bedroht wird. Kouran, angeführt von der skrupellosen Kaiserin Swallow, strebt danach, die Macht des Roten Drachen zu nutzen, um ihre eigenen imperialistischen Ziele zu erreichen. Um Dálnai zu retten, schließt sich Ibuki einer Gruppe von Verbündeten an, darunter der Söldner Eiha, der Assassine Lou, der Priester Meryl und der Krieger Agito. Zusammen versuchen sie, die Bedrohung durch Kouran abzuwehren und gleichzeitig die instabile Macht des Roten Drachen zu bändigen.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass die Beziehung zwischen Ibuki und dem Roten Drachen komplex ist. Der Drache ist eine Quelle immenser Macht, aber seine Kontrolle erfordert Opfer und führt oft zu unvorhersehbaren Konsequenzen. Ibuki muss lernen, mit dieser Kraft umzugehen, während er gleichzeitig seine eigene Identität und seine Loyalität zu seinen Freunden bewahrt. Die Gruppe wird mit moralischen Dilemmata konfrontiert, da sie gezwungen ist, schwierige Entscheidungen zu treffen, um das Königreich zu retten.

Neben den äußeren Konflikten mit Kouran gibt es auch interne Spannungen innerhalb der Gruppe. Eiha, die als Söldnerin zunächst nur an ihren eigenen Vorteil denkt, entwickelt im Laufe der Zeit eine tiefere Bindung zu Ibuki und den anderen. Lou, ein ehemaliger Assassine, kämpft mit seiner Vergangenheit und seinem Wunsch nach Rache. Meryl, die als Priesterin eine spirituelle Rolle einnimmt, versucht, die Gruppe zu führen und moralische Klarheit zu bewahren. Agito, ein Krieger mit einer geheimnisvollen Vergangenheit, spielt eine Schlüsselrolle bei der Verteidigung des Königreichs.

Die Handlung wird durch politische Intrigen, militärische Strategien und die ständige Bedrohung durch die Macht des Roten Drachen vorangetrieben. Die Serie erforscht Themen wie Loyalität, Opferbereitschaft und die moralischen Grauzonen, die in Zeiten des Krieges entstehen. Am Ende steht die Frage, ob Ibuki und seine Verbündeten in der Lage sein werden, das Königreich Dálnai zu retten, ohne dabei ihre Menschlichkeit zu verlieren.