"MD Geist" ist eine zweiteilige OVA, die in einer postapokalyptischen Zukunft spielt. Die Handlung dreht sich um den Protagonisten Geist, einen genetisch modifizierten Supersoldaten, der als "Most Dangerous Soldier" (MD) bekannt ist. Geist wurde ursprünglich für den Kampf in einem brutalen Krieg entwickelt, aber aufgrund seiner unkontrollierbaren Natur in den Orbit verbannt. Jahre später kehrt er auf den Planeten Jerra zurück, der von Chaos und Zerstörung heimgesucht wird. Die Zivilisation ist zusammengebrochen, und verschiedene Fraktionen kämpfen um die Vorherrschaft.

Auf Jerra trifft Geist auf die Überreste der menschlichen Streitkräfte, die von Commander Krüger angeführt werden. Krüger versucht, die Ordnung wiederherzustellen, indem er eine Armee von Kampfrobotern, die Death Force, einsetzt. Diese Roboter sollen die verbliebenen menschlichen Siedlungen beschützen, stellen jedoch eine ebenso große Bedrohung dar wie die feindlichen Fraktionen. Geist schließt sich widerwillig Krügers Truppen an, obwohl seine wahre Loyalität unklar bleibt.

Im Verlauf der Geschichte wird deutlich, dass Geist nicht nur ein einfacher Soldat ist, sondern eine zentrale Rolle in den Ereignissen spielt. Seine Anwesenheit löst eine Kette von Konflikten aus, die die fragile Balance auf Jerra weiter destabilisieren. Die Handlung thematisiert Themen wie Krieg, Überleben und die moralischen Grenzen der Technologie. Geist selbst ist ein ambivalenter Charakter, der sowohl als Retter als auch als Zerstörer agiert. Seine Begegnungen mit anderen Figuren, wie der Soldatin Vaiya, verdeutlichen die Komplexität seiner Persönlichkeit und Motivationen.

Der zweite Teil der OVA, "MD Geist II: Death Force," vertieft die Handlung, indem er die Konsequenzen von Geists Handlungen weiter ausführt. Die Death Force entpuppt sich als noch gefährlicher als zuvor angenommen, und Geist muss sich erneut beweisen, um das Schicksal von Jerra zu beeinflussen. Die Geschichte bleibt düster und actionreich, mit einem Fokus auf die brutale Realität einer Welt, die vom Krieg gezeichnet ist.