"Saber Marionette J to X" ist eine Fortsetzung der Anime-Serie "Saber Marionette J" und spielt in einer fiktiven Zukunft, in der der Planet Terra II von Männern bewohnt wird, nachdem die weibliche Bevölkerung durch eine Seuche ausgelöscht wurde. Die Geschichte setzt die Abenteuer des jungen Otaru Mamiya und seiner drei Marionetten – Lime, Cherry und Bloodberry – fort, die mit menschlichen Emotionen ausgestattet sind und als Saber Marionetten bezeichnet werden. Diese Marionetten wurden ursprünglich als Kampfmaschinen entwickelt, haben jedoch durch Otarus Einfluss menschliche Eigenschaften entwickelt.

Die Handlung von "Saber Marionette J to X" beginnt mit einer scheinbar friedlichen Zeit in Japones, dem Land, in dem Otaru und seine Marionetten leben. Doch die Ruhe wird gestört, als eine neue Bedrohung in Form von Faust, einem mysteriösen und mächtigen Feind, auftaucht. Faust besitzt die Fähigkeit, Marionetten zu kontrollieren und sie gegen ihre Besitzer zu wenden. Otaru und seine Marionetten müssen sich dieser neuen Gefahr stellen, während sie gleichzeitig versuchen, das Geheimnis hinter Fausts Macht und Absichten zu lüften.

Im Laufe der Serie wird die Beziehung zwischen Otaru und seinen Marionetten weiter vertieft, insbesondere die emotionale Bindung zu Lime, die eine zentrale Rolle in der Handlung spielt. Lime entwickelt zunehmend menschliche Gefühle und zeigt eine tiefe Zuneigung zu Otaru, was zu Konflikten und emotionalen Momenten führt. Cherry und Bloodberry, die ebenfalls wichtige Rollen spielen, unterstützen Otaru im Kampf gegen Faust und seine Marionettenarmee.

Ein weiterer zentraler Handlungsstrang ist die Entdeckung der wahren Natur der Marionetten und ihrer Verbindung zu den verlorenen weiblichen Bewohnern von Terra II. Die Serie erforscht Themen wie Identität, Menschlichkeit und die Bedeutung von Emotionen, während die Charaktere gegen äußere Bedrohungen und innere Konflikte kämpfen.

Die Handlung gipfelt in einem finalen Konflikt zwischen Otaru und Faust, bei dem die Zukunft von Terra II und das Schicksal der Marionetten auf dem Spiel stehen. Die Serie endet mit einer Mischung aus Action, Drama und emotionalen Höhepunkten, die die Entwicklung der Charaktere und ihrer Beziehungen abschließen.