In der Welt von Tokyo Ghoul leben Menschen neben Ghouls, Kreaturen, die nur durch den Verzehr von Menschenfleisch überleben können. Ken Kaneki ist ein junger Mann, der zwischen beiden Welten gefangen ist – ein Mensch-Ghoul-Hybride, der entstand, nachdem eine lebensrettende Operation ihm die Organe eines Ghouls verlieh. Während er noch mit seiner neuen Natur und seinem Bedürfnis, Menschenfleisch zu konsumieren, hadert, hat Kaneki im ruhigen Café Anteiku im 20. Bezirk Tokios ein zerbrechliches Gefühl der Zugehörigkeit gefunden. Unter der Leitung des sanftmütigen Yoshimura dient Anteiku als Zufluchtsort für friedliche Ghouls, die versuchen, mit Menschen zusammenzuleben, und Kaneki arbeitet dort Seite an Seite mit der wilden und verstörten Touka Kirishima, die ihn darin trainiert, seine neuen Kräfte zu kontrollieren.

Ihr relativ friedliches Dasein wird durch das Auftauchen eines charismatischen und kultivierten Ghouls namens Shu Tsukiyama zerstört. In Ghoul-Kreisen als „Der Gourmet“ bekannt, ist Tsukiyama ein wohlhabender Feinschmecker, dem die gewöhnliche menschliche Küche langweilig geworden ist und der nun nur noch die seltensten und exquisitesten Aromen sucht. In dem Moment, in dem er den einzigartigen Duft von Kaneki, einem halb menschlichen, halb ghoulischen Hybriden, wahrnimmt, entwickelt er eine obsessive Fixierung darauf, ihn zu seiner nächsten Mahlzeit zu machen. Tsukiyama schleicht sich in Kanekis Leben ein, gibt vor, ein Freund zu sein, während er heimlich plant, seinen beispiellosen Geschmack zu genießen.

Der Konflikt eskaliert, als Tsukiyama Kaneki in ein unterirdisches Ghoul-Restaurant lockt, einen geheimen und dekadenten Ort, an dem sich Ghouls aus der ganzen Welt versammeln, um zuzusehen, wie Menschen als Gourmetgerichte zubereitet und serviert werden. Kaneki wird gefangen genommen und als Hauptgang präsentiert, gezwungen, um sein Überleben gegen Tsukiyama und andere räuberische Ghouls zu kämpfen. Die Situation wird noch verzweifelter, als Tsukiyama Kimi Nishino, die menschliche Freundin von Kanekis ehemaligem Rivalen Nishiki Nishio, entführt und sie als Bauern benutzt, um Kaneki zu manipulieren.

Während die Grenzen zwischen Freund und Feind verschwimmen, müssen die Ghouls von Anteiku sich zusammenschließen, um einen der ihren zu retten. Touka und Nishiki starten einen verzweifelten Gegenangriff gegen Tsukiyama, um Kaneki und Kimi zu befreien. Auch die Commission of Counter Ghoul (CCG), eine Regierungsbehörde, die sich der Ausrottung von Ghouls verschrieben hat, startet einen Überfall auf das Restaurant und verwandelt den Ort in ein chaotisches Dreifronten-Schlachtfeld. Kaneki ist gezwungen, das volle Ausmaß seiner monströsen Fähigkeiten zu konfrontieren, um Tsukiyamas Besessenheit zu überleben und den Klauen sowohl der CCG als auch des Ghoul-Gourmets zu entkommen.