"Star Blazers 2199" ist eine Science-Fiction-Anime-Serie, die eine Neuauflage der klassischen Serie "Space Battleship Yamato" darstellt. Die Handlung spielt im Jahr 2199, in dem die Erde von einer außerirdischen Spezies, den Gamilas, angegriffen wird. Durch die Angriffe ist die Erdoberfläche radioaktiv verseucht, und die Menschheit ist gezwungen, in unterirdischen Städten zu überleben. Die einzige Hoffnung auf Rettung liegt in einer mysteriösen Botschaft von der Planet Queen Starsha vom Planeten Iscandar. Sie bietet der Erde eine Technologie an, die die Strahlung beseitigen und den Planeten heilen kann.

Um diese Technologie zu erhalten, wird das ehemalige Kriegsschiff Yamato in ein Raumschiff umgebaut und mit einem revolutionären Antriebssystem ausgestattet, dem "Wave-Motion-Engine". Die Besatzung der Yamato, angeführt von Captain Juzo Okita, begibt sich auf eine gefährliche Reise nach Iscandar, das 148.000 Lichtjahre entfernt liegt. Die Mission ist mit zahlreichen Herausforderungen verbunden, darunter Angriffe der Gamilas, interne Konflikte und die begrenzte Zeit, da die Erde nur noch ein Jahr lang bewohnbar bleibt.

Zu den Hauptfiguren gehören Susumu Kodai, ein junger Offizier, der nach dem Tod seines Bruders in einem früheren Kampf gegen die Gamilas von Rachegedanken getrieben ist, und Yuki Mori, eine Pilotin und Navigatorin, die eine enge Beziehung zu Kodai entwickelt. Daisuke Shima, Kodais bester Freund und Navigator, sowie der Wissenschaftler Dr. Sakezo Sado und die mysteriöse Sanada spielen ebenfalls wichtige Rollen. Die Charaktere müssen nicht nur die äußeren Bedrohungen bewältigen, sondern auch mit ihren persönlichen Ängsten und Konflikten umgehen.

Die Serie verbindet actionreiche Weltraumschlachten mit tiefgründigen Charakterentwicklungen und thematisiert Themen wie Hoffnung, Opferbereitschaft und die Überwindung von Feindschaft. Die Reise der Yamato wird zu einem Symbol für den Überlebenswillen der Menschheit und die Suche nach Frieden in einer feindseligen Galaxie.