"Pretty Guardian Sailor Moon Crystal: Season III" adaptiert den "Infinity"-Arc des originalen Mangas von Naoko Takeuchi und konzentriert sich auf die Einführung der Sailor-Senshi des äußeren Sonnensystems sowie den Kampf gegen die tödliche Bedrohung durch die Todesschwestern und ihren Meister, Pharaoh 90. Die Handlung beginnt mit dem Auftauchen einer mysteriösen neuen Schülerin namens Hotaru Tomoe, die von ihrer Umgebung gemieden wird und eine fragile, kranke Erscheinung hat. Hotaru lebt mit ihrem Vater, Professor Tomoe, einem Wissenschaftler, der in dunkle Experimente verstrickt ist, die darauf abzielen, eine Verbindung zu einer anderen Dimension herzustellen.
Die Todesschwestern, bestehend aus Kaolinite und den Dämonenbruten Eudial, Mimete, Tellu und Viluy, arbeiten im Auftrag von Pharaoh 90, einem mächtigen Wesen aus der Tau-Nebel-Dimension. Ihr Ziel ist es, die Erde zu erobern, indem sie die Energie der Menschen absorbieren und die "Tau-Formel" aktivieren. Die Sailor-Senshi, angeführt von Sailor Moon, müssen sich dieser neuen Bedrohung stellen, während sie gleichzeitig die wahre Natur von Hotaru aufdecken. Hotaru entpuppt sich als die Reinkarnation von Sailor Saturn, der Senshi der Zerstörung und Wiedergeburt, deren Macht sowohl eine Gefahr als auch eine Hoffnung darstellt.
Im Laufe der Handlung wird deutlich, dass Professor Tomoe von Pharaoh 90 manipuliert wird, um Hotaru als Gefäß für die Inkarnation von Mistress 9 zu nutzen, einer Dienerin von Pharaoh 90. Die Sailor-Senshi kämpfen gegen die Todesschwestern und ihre Dämonenbruten, während sie versuchen, Hotaru zu retten und die Aktivierung der Tau-Formel zu verhindern. Der Höhepunkt der Handlung erreicht seinen Höhepunkt, als Sailor Saturn erwacht und ihre zerstörerische Macht entfesselt, was zu einem dramatischen Finale führt, in dem die Zukunft der Erde auf dem Spiel steht.
Die Charakterentwicklung konzentriert sich stark auf Hotaru und ihre Beziehung zu den anderen Senshi, insbesondere Chibiusa, mit der sie eine enge Freundschaft aufbaut. Die Dynamik zwischen den Sailor-Senshi des inneren und äußeren Sonnensystems wird ebenfalls vertieft, wobei Sailor Uranus, Sailor Neptune und Sailor Pluto eine zentrale Rolle im Kampf gegen die Bedrohung spielen. Die Serie behält den Fokus auf die Themen Freundschaft, Opferbereitschaft und die Balance zwischen Zerstörung und Neubeginn, die im gesamten "Sailor Moon"-Universum präsent sind.