Ein neues Semester beginnt an der mysteriösen Schule, die Charaktere aus verschiedenen Parallelwelten zusammenbringt und die vertrauten Gesichter aus Overlord, KonoSuba, Re:Zero, The Saga of Tanya the Evil und The Rising of the Shield Hero wiedervereint. Doch die erwartete Rückkehr zu friedlichen Schultagen wird gestört, als in beiden Klassen Transferstudenten eintreffen. Klasse 2 begrüßt Otto und Garfiel aus Re:Zero, während in Klasse 1 rätselhaftere Neuankömmlinge erscheinen. Der bedeutendste Zuwachs ist Cid Kagenou, auch bekannt als Shadow, der Anführer der Geheimorganisation Shadow Garden aus The Eminence in Shadow, der zusammen mit seiner ergebenen Anhängerin Alpha ankommt.

Die Schule, eine Chibi-artige Alternativdimension, in der mächtige Fähigkeiten durch die Regeln des Schülerlebens eingeschränkt sind, wird zur Bühne für noch größeres Chaos. Während der Großteil der Besetzung versucht, sich durch alltägliche Aktivitäten wie Blumenanbau, Kochkurse und ein Musikfestival zu navigieren, operiert Cid auf einer anderen Ebene. In seiner selbsternannten Rolle als Schattenlenker bleibt er zunächst im Hintergrund, schläft auf dem Schuldach und beobachtet seine neuen Klassenkameraden. Seine Anwesenheit bleibt nicht völlig unbemerkt; Ainz spürt seine Energie, während Kazuma misstrauisch gegenüber dem unscheinbaren Hintergrundcharakter wird.

Die Dynamik verändert sich dramatisch, als Cid einen grandiosen Auftritt als Shadow hinlegt, Megumins tägliche Explosion kapert und sie in ein spektakuläres Feuerwerk verwandelt, während er seinen ikonischen Satz ausspricht: I am atomic. Diese Tat etabliert ihn sofort als wildcard. Seine Chuunibyou-Persönlichkeit und Besessenheit von Theatralik verwirren und faszinieren die anderen Charaktere gleichermaßen. Ainz, der in Shadow einen Geistesverwandten in der Dunkelheit erkennt, nimmt Kontakt auf, während Tanya beginnt, die mysteriöse Figur zu untersuchen. Kazuma erweist sich als überraschend aufmerksam und schlussfolgert richtig, dass unter der coolen Fassade ein Individuum steckt, das tief in seiner eigenen ausgeklügelten Fantasie verhaftet ist.

Im Verlauf des Semesters spinnt sich die Erzählung durch eine Reihe komischer Vorfälle und charaktergetriebener Handlungsbögen. Die Schüler nehmen an einem Sumo-Turnier teil, bei dem Garfiel sich einen Namen macht. Ein Kochkurs geht schrecklich schief, als Wiz lebende Zombie-Pasta liefert, die die Schüler angreift. Der Held Motoyasu aus The Rising of the Shield Hero trifft ein und verursacht Reibung mit seiner eigenartigen Besessenheit, indem er die meisten Schülerinnen als Schweine betrachtet, während er solche mit Ahoge als Filolials sieht. Eine MMORPG-Sucht erfasst die Schule und enthüllt verborgene Facetten von Charakteren wie Ainz, der endlich jemanden findet, mit dem er über YGGDRASIL sprechen kann, und den Soldaten aus Tanyas Welt, die der Verlockung von Videospielen völlig unvorbereitet gegenüberstehen. Ein Schulausflug in die Berge und ein Endkampf, bei dem alle Schüler sich gegen einen gemeinsamen Feind vereinen müssen, beschließen das Semester. Während dieser Ereignisse verfolgt Cid weiter seine eigene geheime Agenda, knüpft Verbindungen zu Ainz und anderen, während er überzeugt bleibt, dass niemand seine wahre Identität als bloßer Hintergrundcharakter entdeckt hat.